（一）局部视诊
观察外口数目、形态、位置和分泌物情况。
（二）触诊
肛瘘管道穿行于肛周各间隙软组织中或括约肌间，因慢性炎症刺激常会形成纤维化条索。在肛周皮肤上常可触及索状物、肿块或硬结。(https://www.daowen.com)
（三）肛门镜检查
常用双叶肛门镜检查，在原发内口处可见黏膜充血、水肿、凹陷、瘢痕，有时还可见脓液自内口溢出。
（四）探针检查
目的在于了解瘘管行径、长短、深浅，与肛门括约肌的关系及内口位置等。
