目前，中西医结合面临诸多问题和挑战，尤其是中医理论研究，已成为制约中医生存和发展的不可逾越的鸿沟。首先是来自中医工作者自身，对于“守旧派”的中医学者来说，他们认为中医理论是自成体系的，不能用现代科学理论来解释，也不需要学习现代医学和科学。其次，中医学的理论体系确实很独特，它以阴阳学说、五行学说和藏象学说为基础，属于哲学范畴。“西中学”的一些人很难理解中医独特的理论，但他们又不能用纯粹的西医学思维来理解和认识中医，因此在研究中很难找到突破口。
