MALAT-1与选择性剪接

考虑MALAT-1的核散斑定位，MALAT-1可能参与了选择性剪接的调控。有研究证实，MALAT-1能与许多剪接因子，比如SRSF1、SRSF2和SRSF3等发生相互作用。而MALAT-1的减少会导致核散斑与许多外源性或内源性前mRNA剪接因子（包括SRSF1、SRSF3、SF1、U2AF-65、SF3a60）的相互作用减少。如上所述，沉默MALAT-1的表达对核散斑的整体形成无影响，因此它不是一个结构性RNA，但是它可能调节一组与核散斑相关的前mRNA剪接因子。在删除MALAT-1的HeLa细胞中分析了5782个人类盒式外显子的选择性剪接，显示有238个盒式外显子在其外显子融合水平出现了超过10%的改变。大多数情况下，MALAT-1删除导致外显子融合水平的增加，这常常与SR 蛋白的活性相关。所以，MALAT-1极有可能通过调节SRSF1和SRSF2的蛋白水平及它们的磷酸化状态来改变选择性剪接模式。尽管MALAT-1能调节通用过程，比如说选择性剪接，整个转录组和剪接分析则表明MALAT-1的抑制仅仅影响一组次要的转录本。对MALAT-1的这种选择性的一种解释是SR蛋白对前mRNA的选择性，这个过程取决于SR蛋白的剪接位点和外显子的剪接增强序列。因此，不同的基因会受到不同的SR蛋白的调节。因此，MALAT-1不能被描述成一个选择性剪接的通用调节因子，它本身应该具有不同的组织依赖性或发育阶段依赖性或压力依赖性功能。(https://www.daowen.com)