崇圣祠设置较晚。明嘉靖九年（1530年）始设，主祀孔子之父，将叔梁纥封号由元代启圣王改为启圣公，所以名启圣祠。清雍正元年（1723年）改祀孔子五代先人，启圣祠改名崇圣祠。
崇圣祠没有单独的祭祀日期，都是随孔子祭祀而祭祀的，所以祭祀也有释奠、释菜和行香。
