2.2.2 实验方法

2.2.2 实验方法

2.2.2.1 Ef fectene转染细胞

所有试验质粒的转染均采用Effectene转染试剂盒(QIAGEN),试验流程如下:

(1)转染前6h铺种适量S2细胞于6cm细胞培养皿中;

(2)在1.5mL离心管中用EC buffer稀释1μg DNA(终体积150μL);

(3)加入8μL Enhancer,震荡1s后室温静置5min;

(4)加入25μL Effectene Reagent,震荡10s后室温静置10min;

(5)加入适量预热的S2细胞培养基,轻微混匀后迅速加入到细胞中;

(6)稍微摇晃培养皿,将细胞放回培养箱中。

2.2.2.2细胞免疫荧光染色实验

细胞免疫荧光染色步骤如下:

(1)转染前6 h铺种适量S2细胞于培养皿中,同时放入防脱盖玻片;

(2)用Effectene转染S2细胞,培养36h;

(3)用PBS小心清洗贴覆在盖玻片上的S2细胞2次;

(4)用新鲜配制的4%甲醛室温固定20min(小心操作);

(5)用PBS小心清洗细胞3次;

(6)用0.2%Triton X-100封闭10min;

(7)用1%BSA室温孵育1h;

(8)在盖玻片上加上0.2 m L含有1%BSA的一抗,4℃环境中过夜;

(9)用PBS小心清洗细胞3次;

(10)加入二抗室温染色1h;

(11)用PBS小心清洗细胞3次;

(12)在载玻片上滴上包埋液,将有细胞的一面盖在包埋液上,制成装片,荧光显微镜下拍摄。

2.2.2.3免疫共沉淀实验

细胞免疫共沉淀(co-immunoprecipitation)步骤如下:

(1)细胞转染36h或48h后,吹匀细胞,置入15mL离心管,1000g离心5min;

(2)弃培养基,用预冷的PBS清洗细胞2次;

(3)加入裂解缓冲液RIPA Buffer(CST)与1mmol PMSF(裂解前加入),冰上放置10min;

(4)将裂解物转至新1.5m L离心管中,4℃12000g离心10min;

(5)小心吸取10%上清,加入SDS上样缓冲液(碧云天),-20℃环境中冻存;(https://www.daowen.com)

(6)剩余90%上清,加入抗体,摇床4℃环境中过夜;

(7)加入20μL凝胶珠(Sigma),摇床4℃2h;

(8)4℃8200g离心30s收集凝胶珠,用裂解缓冲液清洗4遍,加入上样缓冲液;

(9)100℃煮5min,进行SDS聚丙烯酰胺凝胶电泳。

2.2.2.4免疫印记实验

蛋白免疫印迹(Western blot)所用凝胶由SDS-PAGE凝胶配制试剂盒(碧云天)配制,步骤如下:

(1)用胶条将长玻璃板下端封住,灌入10%分离胶至距离短玻璃板4cm,用100%乙醇封住;

(2)冷凝60min后,将乙醇倒出,吸干,灌满5%浓缩胶后立即插入梳子;

(3)冷凝45 min后,将1×电泳缓冲液倒入电泳槽,并淹没短玻璃板;

(4)取蛋白上清与5×SDS上样缓冲液混合后,100℃煮5min使蛋白变性,用微量进样器以10~20μL的量注入点样孔,在不加样槽中加入缓冲液;

(5)以浓缩胶中80V电压30min,分离胶120V 70min进行电泳(根据蛋白分子量大小适当调整电泳时间);

(6)取下胶板,切去浓缩胶,将提前用甲醇激活的PVDF膜按“滤纸—凝胶—PVDF膜—滤纸”的顺序,恒流0.3A转膜1h;

(7)根据marker分子量剪裁PVDF膜,用5%脱脂奶粉封闭液1h;

(8)加一抗(配于1×PBST+5%牛血清),4℃环境中过夜;

(9)用1×TBST洗3遍,每次5min;

(10)加二抗(配于1×PBST+5%牛血清),室温孵育1h;

(11)用1×TBST洗3遍,每次5min;

(12)用平头镊将膜取出,吸除多余液体,置于洁净保鲜膜上,每10cm2加1m L ECL工作液(碧云天),放置1min;

(13)倒去ECL工作液,用吸水纸吸走过多的液体,用GE成像系统显影。

2.2.2.5 qRT-PCR

将新鲜解剖的果蝇翅成虫盘放入1.5 m L离心管中,用PBS清洗后,加入0.5m L Trizol,用研磨棒充分研磨,按照PureLink®RNA小提试剂盒(Ambion)中操作手册提取RNA,然后用PrimeScript TMRT Master Mix(Ta KaRa)将RNA逆转录,之后用SYBR®Premix Ex Taq TMⅡ(TaKaRa)在Stratagene MX3000P系统(Stratagene)进行定量PCR反应。

2.2.2.6双荧光素酶报告实验

将p GL3-Basic-Rho1(E1/E2/E3),copia-renilla报告质粒与p Ac5.1/V5-HisB Yki-HA表达质粒用Effectene转染法(QIAGEN)共转到S2细胞中。转染36 h后,按照Dual-Luciferase Reporter assay system提供的操作手册(Promega)进行处理后,用FlexStation 3仪器(Molecular Devices)检测荧光信号。

2.2.2.7染色体免疫共沉淀实验

染色体免疫共沉淀(chromatin immunoprecipitation,ChIP)是用于研究体内DNA与蛋白质相互作用的方法。用Effectene转染法(QIAGEN)将过表达Yki-HA与Sd的质粒瞬转到S2细胞中,按照Magna ChIPTMG Tissue Kit提供的操作手册(Millipore)对细胞进行相应处理,用anti-Sd、anti-HA及anti-mouse IgG抗体进行免疫沉淀,对沉淀下来的复合物进行清洗,除去非特异性结合,洗脱得到富集的靶蛋白-DNA复合物,解交联将DNA与蛋白分离,最后以浓缩的DNA为模板进行定量PCR反应。

【注释】

[1]取自网络http://www.gene-quantification.de/si-rna.html.

[2]改自网络图片http://www.the-scientist.com/?articles.view/articleNo/34435/title/Instant-Messaging.