关于温病的病因问题
1．六淫之邪不是构成传染病的主要原因 吴氏认为温疫病的致病原因是“厉气”（又名戾气、疫气、杂气）。在此以前，对时行疫病的病因都认为是“非其时而有其气”，如“春应暖而反大寒，夏应热而反大凉，秋应凉而反大热，冬应寒而反大温”等。吴氏对这种以气候反常作为传染病致病原因的看法是极力反对的，他认为：“春温夏热秋凉冬寒乃四时之常，风雨阴晴稍为损益，假令春应暖而反多寒，其时必多雨，秋应凉而热不去，此际必多晴，夫阴晴旱潦之不测，寒暑损益安可以为拘，此天地四时之常事，未必为疫。”指出了气候反常，亦属四时之常事，并非疫病原因。事实也是如此，在气候反常的季节未必见有疫病，而现今所看到的热性传染病，又不一定在气候反常的情况下才会发生、扩展。所以吴氏明确提出：“夫疫者，感天地之戾气也，戾气者，非寒非暑、非暖非凉，亦非四时交错之气，乃天地间别有一种戾气。”从温疫病具有传染性的前提出发，认为单纯的六淫之邪不能成为疫病，疫病的致病主因，必然是六淫之外的别有一种原因——戾气，无疑，这种看法是有其进步性的，是符合科学观点的。
2．温病的主因是温热病毒 重订本《温病学讲义》认为：“温病的致病主因，是感受温热病毒，它是在四时不同气候条件下所产生的。”这较之吴又可所说的“厉气”，更能合乎科学常识，也就进一步明确了温病的致病原因不是外感六淫，而是属于生物性的病毒为患，所以温病具有传染性。若纯是物理性的风、寒、暑、湿、燥、火为病，它绝不能引起传染流行。一切生物都是在一定的气候条件下生长起来的，温热病毒当然亦不例外。温热病毒的滋生、生长，与一定的气候变化不能分开，其入侵人体乃至发生病变，亦每与一定的气候变化有关，所以从温病的发病学来说，温热病毒是温病的致病主因，而风、寒、暑、湿、澡、火等六气变化，仅是其诱发因素。六气的自然变化，是不能改变的规律，而病毒是可以制止或消灭的；人不能离开六气变化而生存，而对于病毒是可以防止或避免其入侵人体的，所以明确温热病毒是温病的主因，这就要求我们可以想一切办法用一切措施来消灭温热病毒，便能有效地制止和消灭温病的发生、传播。
3．有不同的温热病毒才有不同种类的温病 吴氏认为“天地之杂气，种种不一，亦有优劣，为病不同”，并认为“牛瘟、羊瘟、鸡瘟、鸭瘟等，牛病而羊不病，鸡病而鸭不病，人病而禽兽不病，究其所伤不同，因其气各异也”，这就明确地指出，各种不同的传染病，是有不同致病原因的。重订本《温病学讲义》认为温热病毒亦有多种，如风热病毒、暑热病毒、湿热病毒、燥气病毒等，并具体地论述了各种温热病毒的致病类型、发病特点等。这较之吴又可所谈的杂气而没有名称分类，当然是有进一步的发展，但仅将温热病毒说成是风热、暑热、湿热、燥气等四种，还不足以说明临床上有诸多种类的温病，而且这种以四时主气来作为温热病毒定名的主体，并以此划分种类，很易使人误解为在病毒入侵人体的同时，风、暑、湿、燥等六气变化，亦随之入侵人体为患。另外以四时主气来称名温热病毒，在某些具体内容上，亦很难说得圆转。准如《讲义》所谈，由风热病毒所形成的温病名风温、暑热病毒所形成的温病名暑温、湿热病毒所形成的温病为湿温、燥气病毒所形成的为秋燥，则他如春温、伏暑、大头瘟、烂喉痧等温病，将由何种温热病毒所致？是属于四时六气中的何种主气？如从病候的性质来说，湿温是湿热性质的病毒，则湿热痢、伏暑等湿热疾患，当亦属湿热病毒，同一湿热病毒，何以为病不一，诸如种种问题，都是不易解决的。(https://www.daowen.com)
根据各种温病的各具特点，是由各种不同的温热病毒所决定（当然还依存于机体的反应，下同）来论证，可知风温的特点是由风温病的病毒所决定，春温病的特点是由春温病毒所决定，其他各种温病，也都由其他各自的病毒所决定。再根据吴又可“杂气种种不一”的论点，可知虽在同一气候条件下，而其所滋生的病毒可有多种，并不是单一的。准此而言，在春季温风当令的气候条件下所形成的病毒，不必皆是风热病毒，亦可有其他病毒。换言之，春季仅谈风热病毒，是不能解决春季为什么有风温、春温等不同疾病的问题。若说成“在春季气候温暖条件下所形成的温热病毒有风温病毒、春温病毒等”，这就比较容易地解决春季为什么有风温、春温等不同疾病与各有其不同病候特点的问题，春温初起所以呈里热见证、风温初起所以呈肺卫见证的特点，是由致病的病毒不同所决定。所以本人认为，与其将温热病毒以四时主气来标名，倒不如以各种温病的病名来标名（如春温病因即是春温病毒，风温是风温病毒、伏暑是伏暑病毒、烂喉痧是烂喉痧病毒等），似乎更为确切，而且在说理上可以有较大程度的灵活性，既有助于解决各种温病的病候特点问题，同时亦可解决在同一气候条件下为什么有各种不同温病的问题。
4．如何对待“病毒”这一新课题 名以“温热病毒”，虽标志着是一种生物性的致病因素，但从其实际意义上来说，还是着重于抽象的说理。因此若以西医学中所谈到的病毒来与之等量齐观，或以西医学所谈病毒的概念来追究现代温病学所谈病毒的一切，那就不属于中医学所应该回答的问题。从历史发展来看，以“病毒”来作为温热病的抽象说理，前贤何廉臣所编的《全国名医验案类编》与《增订伤寒百证歌》中已早有记载，现在温病学中重新把它提到应有的地位并且加以具体阐述，正亦体现了在继承的基础上又进行了发扬的工作。
总的来说，温病学中所谈到的“病毒”，是一新的课题，从温病具有传染性的实际情况出发，把属于生物性的温热病毒看成是温病主因，是绝对正确的，是合乎科学常识的，一新课题的产生，要带来些一时不易理解的问题，这是难免的。所以我的理解，温病学中所谈到的“病毒”是属于温病病因学说方面一个方向性的问题，至于有因“病毒”所带来的一时不易解决的问题，那是另外一回事，从发展的观点来看，正要求我们对此应该不断加以修改、补充，这又是我们全体中医工作者的共同职责，而不是几个少数人的事情。