临床应用以下法为多

（1）书中吴氏多用下法，且后世医家亦多论及吴氏喜用下法，但吴氏应用下法均是以祛邪和宣通气机为目的，与其病机论述是相一致的。“邪留血分，里气壅闭，则伏邪不得外透而为斑。若下之，内壅一通，则卫气亦从而疏畅，或出表为斑，则毒邪亦从外解矣。”“既而肠胃燥结，下既不通，中气郁滞，上焦之气不能下降，因而充积，即膜原或有未尽之邪，亦无前进之路……得大承气一行，所谓一窍通，诸窍皆通，大关通而百关尽通也。向所郁于肠胃之邪，由此而下，肠胃既舒，在膜原设有所传不尽之余邪，方能到胃，乘势而下也。”疫邪经口鼻而入，邪气结滞于里，膜原之邪无路可出，需气机流通，邪方可乘势而出，故用下法使内壅得解，气机得通，则疫邪或从表或从里而解。“更有邪气传里，表气不能通于内，必壅于外，每至午后潮热，热甚则头胀痛，热退即已，此岂表实者耶？以上似表，误为表证，妄投升散之剂，经气愈实，火气上升，头疼转甚。须下之，里气一通，经气降而头疼立止。”疫邪致病，表里气机失于流通而现类似表证之症状，但实为气机壅阻，若辨证出现误差而误用升散之剂，则会“头疼转甚”，需用下法使气机通畅，气机流通则诸症缓解。(https://www.daowen.com)

（2）“大便闭结者，疫邪传里，内热壅郁，宿粪不行，蒸而为结，渐至更硬，下之。结粪一行，瘀热自除，诸症悉去。”“大肠胶闭者，其人平素大便不实，设遇疫邪传里，但蒸作极臭，然如黏胶，至死不结，但愈蒸愈闭，以致胃气不能下行，疫毒无路而出，不下即死，但得黏胶一去，下证自除，霍然而愈。”“既传入胃，必从下解。疫邪不能自出，必藉大肠之气传送而下，而疫方愈。”疫邪传里，不论有无结粪，在里之气机均结滞不通，故下法的目的是宣通气机，使疫邪去而病愈，而非单纯下结粪。故吴氏认为“承气非专为结粪而设”。