以能力为重点，创新临床医师培养体系
上海市医学院校在“5+3”项目实施过程中，着力于医学教育发展与医药卫生事业发展的紧密结合，着力于人才培养模式和体制机制改革的重点突破，着力于医学生职业道德和临床实践能力的显著提升，着力于医学教育质量保障体系的明显加强，创新临床医师培养体系。在“5+3”为主体的临床医学人才培养体系中，医学生完成5年的医学院校教育后，一部分毕业生选择考研攻读临床医学科学学位，但绝大部分将进入住院医师规范化培训基地进行为期3年的培训，考核通过后，取得医师执业资格，其中一部分医师直接进入社区或者二级医院工作。此外，还有一部分医师希望在大医院做“分工更细”的专科医生，如神经内科、泌尿外科等，就要在住院医师规范化培训结束后，进入专科医师规范化培训基地继续学习，这被称为“5+3+X”（X为专科医师培训）。
（一）教育制度创新
“5+3”模式不仅有机结合了临床医学专业学位教育和住院医师规范化培训，而且有效衔接了院校教育和毕业后教育。通过明确临床硕士“双重身份”，打破了本科毕业生在“就业（住院医师）”和“在读（研究生）”之间“非此即彼”的束缚；实现了“研究生招生和住院医师招录、研究生培养和住院医师培训、学位授予标准与医师准入制度”的“三个结合”；以“四证合一”解决了医学教育与执业医师制度之间的矛盾，临床医学在读硕士经住院医师规培1年以后，可以本科学历报名参加国家执业医师资格考试，获得医师资格证书和住院医师规范化培训合格证书，经学位论文答辩可获得研究生毕业证书和学位证书。
“四证合一”包括《执业医师资格证书》《上海市住院医师规范化培训合格证书》、《硕士研究生学历证书》和《临床医学硕士专业学位证书》。通过“四证合一”的制度创新，实现了在医师培养过程中的医学教育和卫生行业培训两者的紧密结合，有利于切实提高医学生的临床专业素质和临床技能，以满足社会发展对高层次应用型医学人才的需求。通过“四证合一”的制度创新，培训医院组织本项目临床医学专业学位硕士在培养期间参加执业医师资格考试，有效地解决了临床医学专业学位研究生进行临床能力训练和培养所面临的违法行医风险；由于“研究生培养过程和住院医师规范化培训相结合”，临床医学专业学位研究生的临床技能培训完全达到了住院医师规范化培训要求（获得培训合格证书），研究生毕业后也就不再需要重复进行住院医师规范化培训。
（二）协同机制创新
“5+3”模式以临床医学专业学位教育改革为突破口，立足教育和卫生两大民生工程，既是贯彻国家教育规划纲要的具体实践，又服务于医药卫生体制改革的需要。
“5+3”模式在上海的探索和实践充分体现了医教结合，协同创新。上海市成立专门工作机构负责实施“临床医学硕士专业学位教育与住院医师规范化培训结合的改革试验”，在项目实施过程中，通过政府、行业、高校、医院形成合力，确保改革试验深入推进，形成了教育卫生部门的良好合作机制，出现了“教改推医改、医改促教改”的生动局面。机构人员组成也充分体现了上海市教委、卫生局、各相关高校、培训医院共同参与的临床医学教育管理体制和管理机制的“协同创新”。由上海市教委和卫生局分管领导、各大学分管校长组成住院医师规范化培训与临床医学硕士专业学位教育衔接改革领导小组，负责该项工作的全面实施；由住院医师规范化培训和专业学位研究生教育的专家共同组成专家小组，负责指导相关工作的实施；由上海市学位办、卫生局科教处、大学研究生院、医管处和培训医院相关负责人组成工作小组，具体实施此项工作。在项目试点过程中，工作小组定期召开联席会议，具体制订各项规章制度，研究解决项目开展过程中遇到的各种问题，协调各高校执行上海市的统一规定。
（三）实践教学创新
“5+3”模式突出了能力培养，以培养合格医师为目标，以岗位胜任力为导向，以职业素养和临床能力培养为重点，加强质量保障体系建设。
在课程体系、课程内容和教学方式等方面，本项目培养方案充分体现了住院医师“不能脱离临床规范化培训”的特征。课程学习实行学分制，由政治、英语、专业基础和专业理论等课程组成，所有课程均以上海市统一组织的网络课程学习为主。其中，基础理论课和住院医师规范化培训公共科目完全一致；专业理论课由上海市统一组织各培训医院根据住院医师培训标准细则要求，学习有关的专业理论知识，掌握本学科基本理论，了解相关学科的基础知识。本项目2010～2013级临床医学专业学位研究生通过以上“网络化课程”的学习，共同的体会是本项目网络课件和教学方式既满足了“住院医师”特殊群体在规范化培训期间个体学习时间的自主特点，也体现了临床医学专业学位“研究生”课程质量的高水平和现代化。
在临床技能训练方面，传统的临床医学专业学位教育没有和住院医师规范化培训有机结合，对于临床能力没有强制性要求，研究生要花大量时间完成课程学习（脱离临床培训6个月以上），有些医学院校的临床医学专业学位和科学学位课程设置和教学要求甚至完全相同，使得专业学位研究生临床技能训练时间严重不足。而“5+3”模式下，专业学位硕士必须严格按照《上海市住院医师规范化培训细则》要求进行临床技能训练，完成包括内科、外科、妇产科、儿科、急诊科、神经内科、皮肤科、眼科、耳鼻喉科、精神科、小儿外科、康复医学科、麻醉科、医学影像科、医学检验科、临床病理科、口腔科、全科医学科等18个学科的临床培训轮转。为保证临床培训质量，上海市制定了统一的培训大纲和考核标准，开展了带教师资培训，建立了培训质控体系。住院医师规范化培训考核分为培训过程考核和培训结业考核，以培训过程考核为重点，培训过程考核合格和依法取得执业医师资格是参加培训结业考核的必备条件。
在专业学位论文方面，传统的临床医学专业学位研究生培养方案并没有涉及专业学位论文基本要求和评价指标体系，许多医学院校的导师常常安排自己带教的临床医学专业学位研究生去完成自己的基础医学研究课题，并要求专业学位研究生和科学学位一样发表SCI收录论文。而目前的专业学位硕士培养方案明确“学位论文类型为病例分析报告或文献综述等，学位论文应紧密结合临床实际，以总结临床实践经验为主”。这样就从根本上杜绝了将临床医学专业学位硕士学位论文要求等同于科学学位硕士，改变了“重科研、轻临床”的倾向。