小麦上的两种腥黑穗病表现症状无差别。病株一般较健株稍矮，分蘖增多。病穗较短，直立，颜色较健穗深；初为灰绿色，后变为灰白色。颖壳略向外张开，露出部分病粒菌瘿。小麦受害后，一般全穗麦粒均变成病粒。病粒较健粒短而胖，初为暗绿色，后变为灰黑色，外面包有一层灰褐色薄膜，里面充满黑粉冬孢子，病粒与健粒极易区别（图3～图6）。
图3 小麦腥黑穗病，病穗直立
图4 小麦腥黑穗病，颖壳张开，露出病粒
图5 小麦腥黑穗病，灌浆初期病健籽粒对比
图6 小麦腥黑穗病，收获后病健粒对比
