根据结石发生部位可分为肝内和肝外胆管结石。肝内胆管结石与胆道感染、胆汁淤滞、胆道寄生虫有关。结石多为胆色素混合性结石，可多发，其特点是形状不整、质软易碎、大小不一，也可呈铸形或管状结石，也可呈泥沙样积聚在扩张的胆管内。好发于左、右肝管汇合部或左肝管内。其近端胆管可扩张，甚至形成肝内脓肿。
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结石引起胆管系统的梗阻和反复感染，最终导致胆管狭窄，扩张和肝脏的纤维化。
