国家食品药品监督管理总局负责全国GSP认证工作的统一领导和监督管理；负责与国家认证认可监督管理部门在GSP认证方面的工作协调；负责国际间药品经营质量管理认证领域的互认工作。
国家食品药品监督管理总局食品药品审核查验中心负责实施国家食品药品监督管理总局组织的有关GSP认证的监督检查；负责对省、自治区、直辖市GSP认证机构进行技术指导。
省、自治区、直辖市药品监督管理部门负责组织实施本地区药品经营企业的GSP认证。
