以方类证，方不拘经

柯氏有感于《伤寒论》年代久远，经诸家编次，更有多次变乱，早已非仲景之原貌，其间难免会有错简脱落、断章取义之处，以致彼此矛盾，黑白不辨，令学者无所适从。他反对方有执、喻嘉言的“三百九十七法之说”，认为此说既无补于先贤，又无功于后学。他不同意“三纲鼎立”之说，认为那是埋没仲景心法。他更反对那种不敢增减一字、移换一节的保守观点。他认为对于《伤寒论》应该“凝神定志，慧眼静观，逐条细勘，逐句研审”，方能把握仲景学说之精华，以合临证之实用。(https://www.daowen.com)

柯氏从仲景有太阳证、桂枝证、柴胡证等悟出：将《伤寒论》的条文以六经分证，分为太阳、阳明、少阳、太阴、少阴、厥阴等脉证，再从六经脉证里列出本经的纲领性条文作为总纲，最后以方类证，分别集中该汤证的相关条文，并加以讨论和发挥。这种“分篇各论，挈其大纲，详其细目，证因类聚，方随附之”的注疏方法，别开生面，独具一格。正如柯氏本人所言：“以证名篇，而以论次第之，虽非仲景编次，或不失仲景心法。”如在太阳病中分列桂枝汤证、麻黄汤证、葛根汤证、大青龙汤证等11证类。桂枝汤证类列有关脉证16条，桂枝坏证18条，桂枝疑似证1条，有关桂枝附方18方，如桂二麻一汤、桂枝加附子汤、芍药甘草汤等。麻黄汤证类列有麻黄汤脉证14条，麻黄汤、柴胡汤相关脉证1条，麻黄桂枝各半汤2条，汗后虚证6条，麻黄汤变证4条，有关麻黄汤证方5方，其方证的归属和顺序安排，大致是根据疾病的性质和形层的深浅。条分缕析，实用性强，深为临床医家所推崇。为不致后学迷津，柯氏还逐条细察，进行删改补正。言必有根有据，并且还细心地提示后人“本论每多倒句，此古文笔法耳”“本论中一字句最多……俱不得连续，连读则失其义矣”。足见其对仲景之学研究之深刻。柯氏对后世医家的影响颇大，在其思想方法的引导下，后来的诸家从不同的角度来揭示辨证论治——仲景学说的实质，如按法类证编次、按因类证编次、按理类证编次等。