以六经统方证，力倡辨证论治

柯氏认为王叔和整理虽按六经编次，因六经是六个大证候群，而各经之中包含了许多方证，只有将这些方证有机编次，才能有效地体现仲景的辨证论治思想，故《伤寒论注》是以六经统方证的方法整理的。《凡例》曰：“起手先立总纲一篇，令人开卷便知伤寒家脉证得失之大局略矣；每经立总纲一篇，读此便知本经之脉证大局矣；每篇各标之证为题，看之便知此方之脉证治矣。”如太阳经除有伤寒总论、太阳脉证二章概论外，其他均以方证汇编，有桂枝汤、桂枝汤服法、桂枝汤方禁共20条，桂枝汤类方19条，麻黄汤、麻黄汤方禁15条，麻黄汤类方11条，葛根汤及类方4条，大小青龙汤5条，五苓散11条，十枣汤1条，陷胸汤11条，泻心汤10条，抵当汤6条，各汇成篇章。还有火逆诸证12条、痉湿暍证16条亦各编成章。其他五经也按六经统方证进行编次。正如柯氏在《凡例》中所述：“是编以证为主，故汇集六经诸论，各以类从。其证是某经所重者，分列某经。如桂枝、麻黄等证列太阳，栀子、承气等证列阳明之类。其有变证化方，如从桂枝更变加减者，即附桂枝后；从麻黄证更变加减者，附麻黄证后。”柯氏认为，不必拘泥于仲景的编次，重要的是传仲景的辨证心法，使“仲景之道，至平至易，仲景之门，人人可入”。柯氏这种证因类聚、方随附之、纲举目张的编次方法，突出了六经学说在《伤寒论》中的主导作用，使每方的主证从各条文中归纳起来，完整地体现各个方证的脉证，明确指出主证、次证及类证的鉴别，对于临床推广应用仲景之方及掌握其辨证论治的思想，无疑有很大的帮助。(https://www.daowen.com)