lncRNA的来源与分类

整个人类基因组确定时，只有20000～25000个蛋白编码基因，但它们仅仅代表不到2%的人类基因组。而且，有限数量的蛋白编码基因无法解释人类发育和生理的复杂性。近年来，因高通量测序技术的快速发展，科学家发现有大约98%的“垃圾”DNA转录为非编码RNA（ncRNA），包括短的和长的ncRNA。各种各样的ncRNA可分为两类：结构性和调控性 ncRNA。结构性 ncRNA包括转运RNA（tRNA）、核糖体RNA（rRNA）、核仁小RNA（snoRNA）。基于ncRNA的长度，调控性ncRNA可以进一步分成三组：①短链非编码 RNA（short ncRNA），包括微RNA（microRNA，22～23 nts）和 piwi-相互作用RNA（piRNA，26～31 nts）；②中链非编码 RNA（medium ncRNA，50～200 nts）；③长链非编码RNA（lncRNA，＞200 nts）。在人类，超过3300个lncRNA得到鉴定，而在哺乳动物基因组，有约23000个lncRNA。(https://www.daowen.com)

lncRNA的生物起源相当复杂。一般来说，大多数lncRNA的转录通过RNA聚合酶（RNAP）Ⅱ，一些lncRNA已被报道其转录由RNAPⅡ介导，而且，大多数lncRNA是拼接的、多聚腺苷酸化的、5'加帽的。一些lncRNA在进化上是保守的，呈低水平表达。大部分lncRNA具有高度保守的近端启动子序列、外显子序列、内含子序列或RNA二级结构。lncRNA源自内含子、外显子、基因间、基因内、启动子区域、3'和5'-非翻译区（UTR）、增强子序列，而且有时是双向转录的。特别是一大群lncRNA与已知蛋白编码转录本是反义的，也被称为天然反义转录本（NATs）。NATs分为两个亚型：顺式NATs（cis-NATs），转录自同一基因位点的相反DNA链；反式NATs（trans-NATs），转录自远端位点。与信使RNA和结构性ncRNA不同，大多数lncRNA定位于细胞核。一些lncRNA也被发现同时定位于细胞质和细胞核。然而，有一些lncRNA则特异性地分布于细胞质。