lncRNA在胃癌中的相关研究
胃癌是严重危害人类健康的恶性肿瘤,其病死率居全世界肿瘤的第二位。近年来,大量的研究证实,lncRNA参与了胃癌的发生和发展。
HULC在胃癌细胞及组织中过表达,而且其表达与转移相关。在SGC7901细胞中,下调HULC抑制了细胞的增生和迁移,促进了细胞凋亡,而过表达则得到了相反的效果。此外,沉默HULC能有效地逆转上皮间质转化。
Fer-1-样蛋白4(Fer-1-like protein 4,FER1 L4)在胃癌组织中低表达,并且与肿瘤的大小、组织学分级、侵袭深度、淋巴结转移、远处转移、TNM分期、静脉及神经侵犯、血清CA724相关。ANRIL在胃癌组织中表达上调,且可以作为胃癌患者整体生存的一个独立预测因子。此外,研究者证实ANRIL通过结合PRC2,在表观遗传学水平沉默mir-99a/mir-449a,从而调节mTOR和CDK6/E2F1通路,这可以部分解释ANRIL介导的细胞增长调控。有趣的是,通过ANRIL沉默mir-449a可促进E2F1的表达,同时,E2F1的上调促进ANRIL的表达,因此形成了一个正反馈循环,继续促进胃癌细胞增生。综上所述,ANRIL能在表观遗传水平与microRNA相互作用,促进lncRNA指导的人类胃癌诊断和治疗的发展。
lncRNA-AK058003在缺氧条件下表达升高。研究者发现:AK058003在胃癌组织中高表达,并且无论是在体内还是体外,它都可以促进缺氧诱导的胃癌细胞的迁移和侵袭,而这一功能的发挥在一定程度上依赖于转移相关基因γ-synuclein(SNCG)。
ncRuPAR是一个在胚胎生长过程中能上调蛋白酶激活的受体-1(protease-activated receptor-1,PAR-1)表达的lncRNA分子。 研究发现 ncRuPAR在胃癌组织中显著下调,而PAR-1和VEGF的表达则明显升高。此外,ncRuPAR 被证实其表达水平与肿瘤侵袭深度、淋巴结转移、远处转移、肿瘤大小及TNM分期明显相关,且与PAR-1和VEGF的mRNA水平呈负相关。
相比邻近的正常组织和正常胃上皮细胞,LINC00152在胃癌组织及胃癌细胞系(BGC-823、MGC-803和SGC-7901)中的表达水平显著升高。另外,LINC00152在胃癌患者胃液中的表达高于正常对照组,而且它在胃液中的高表达与侵袭相关。
生长停滞特异性转录本5(growth arrest-specific transcript 5,GAS5)在胃癌组织中的表达水平显著下降,且与肿瘤大小及晚期病理分期相关。体内外实验证实:异常的GAS5表达抑制胃癌细胞增生,诱导细胞凋亡,反之亦然,而GAS5对胃癌细胞增生的影响可能部分通过调节E2F1和p21的表达来实现。
lncRNA AC096655.1-002,又名长链基因间ncRNA 876(LINC00876)、胃癌相关的转录本(gastric cancer-associated transcript 1,GACAT1),是一个转录本长度为577 nt的lncRNA,其定位于2号染色体的正义链。lncRNA AC096655.1-002 在胃癌组织中的表达显著下调,而且它的表达水平与淋巴结转移、远处转移、TNM分期及肿瘤的分化密切相关。(https://www.daowen.com)
HmLincRNA717,又名GACAT2,其基因定位于人类染色体18p11上,转录本长度为818 nt。相比GES-1,HmLincRNA717在胃癌细胞系AGS、BGC-823、HGC-27、MGC-803和SGC-7901中的表达明显下降,而相比癌旁正常组织,其在胃癌组织中的表达也显著下降。HmLincRNA717的表达与肿瘤的远处转移、静脉侵犯和神经侵犯相关。
lncRNA-AC130710又名GACAT3,其基因定位于人类染色体2p24上,转录本长度为1096 nt。lncRNA-AC130710在MGC-803中的表达高于GES-1,在MGC-803中上调miR-129-5p后,AC130710的表达明显下降。
结肠癌相关转录本1(colon cancer-associated transeript 1, CCAT1),定位于8号染色体的基因间区,在胃癌组织中呈高表达,且与转录因子c-Myc的水平相关。细胞增生实验与Transwell 实验表明:下调CCAT1的表达,抑制了胃癌细胞的增生与侵袭转移能力。因此,CCAT1可能成为治疗胃癌的一个潜在的重要靶点。
HOTAIR,全长2.2 kb,定位在哺乳动物12q13.13上的HOXC位点。体内外实验表明,过表达HOTAIR能够促进胃癌细胞的增生、迁移和侵袭。此外,抑制HOTAIR的表达可以通过调节Snail的表达水平来逆转EMT。尤其是HOTAIR可作为ceRNA与miR-331-3p相互作用,从而介导HER2的去抑制,因此可在转录后水平调控胃癌的发生与发展。
H19,是一个父系印记基因,定位于11p15.5靠近端粒的区域。RT-PCR证实H19在胃癌组织与细胞中的表达水平明显升高,而且异常的H19表达可以促进细胞的增生,而下调H19则有助于胃癌细胞的凋亡。此外,本实验还通过RIP和RNA pull-down等实验证实:H19与p53相关,且H19能够抑制p53的活性及p53靶基因Bax的蛋白水平。此外,多个研究表明:H19在胃癌中的作用还与ISM1的上调、miR-675介导的CALN1抑制、H19/miR-675/RUNX1 通路及c-Myc密切相关。
母系表达基因3(maternally expressed gene 3,MEG3),是一个印记基因,定位于人类染色体14q32.3。研究发现:下调MEG3的表达可以促进细胞增生,而MEG3异常表达则会抑制细胞增生,促进细胞凋亡,并能够介导p53的表达。除了上述结果,我们还发现,MEG3的表达受表观遗传学调控,比如DNA甲基化。
胃癌高表达转录本1(gastric carcinoma high expressed transcript 1,GHET1)在胃癌组织中表达上调。过表达GHET1促进胃癌细胞增生,下调GHET1则抑制其增生。研究证实GHET1与胰岛素样生长因子2 mRNA结合蛋白1(IGF2BP1)相关,且能增强c-MycmRNA与IGF2BP1间的相互作用,从而增加c-Myc mRNA的稳定性及表达。
(李 峰)