信息建设：滞后带来管理成本提高

基础数据统计口径不一。新农合和城镇居民医保的信息技术系统建设普遍不足，民政、人社和卫生基础数据统计口径不一致，既增加了财政配套资金支出，又造成了不理想的低参保率，出现筹资过程中的交叉现象和补偿过程中的超标支付现象。如筹资时属于民政救助的贫困户在自己已交费的情况下，市民政局又重复给予救助，增加了财政配套资金支出。如高平市新农合管理中心应由民政全部救助的贫困人口数和五保人口数的参合率分别为60.14%和63.34%，原因是相关部门人数的统计不准确，民政局的统计人数与拨付的实际救助人数有差异，造成了统计基数过大进而形成了不理想的低参合率。

基金监管难度和风险增加。由于信息化建设相对滞后，新农合和居民医保的管理目前尚处于没有统一软件管理，仍靠手工操作的阶段。乡镇的网络直报尚未实现，仍沿用手工操作。复杂的手工操作容易出现错误，管理成本较高，同时也增加了基金监管的难度和基金风险。