“两课”是高校思想政治教育的主要渠道
1993年7月26日，在全国高等学校党的建设工作会议国家教委主任朱开轩同志的报告中，第一次将马克思主义理论课和思想政治教育课两类课程合称“两课”，高校思政课进入“两课”时代。
1991年8月3日，《国家教育委员关于加强和改进高等学校马克思主义理论教育的若干意见》提出：“在高校的全部思想政治工作中，马克思主义理论课在对青年学生系统讲授马克思主义科学理论，进行科学世界观、人生观和价值观的教育，以及党的路线、方针和政策教育方面，担负着特殊重要的责任。它是“高校思想政治教育的主要阵地和主要渠道。”这是因为政治的坚定源于理论的清醒，“青年学生对于资产阶级社会政治学说本质的分辨和批判能力的提高，对于科学世界观、正确人生观、坚定的社会主义信念和远大共产主义理想的培养和树立，只有建立在科学的理论基础上，通过全面的和系统的马克思主义科学世界观和方法论的教育才可能实现”[33]。1993年8月，《关于新形势下加强和改进高等学校党的建设和思想政治工作的若干意见》将学生思想政治教育的主渠道从“马克思主义理论课”拓展为“两课”，即“马克思主义理论课”和“思想政治教育课”。1995年10月，《关于高校马克思主义理论课和思想品德课教学改革的若干意见》提出：“高校‘两课’是高校思想理论教育的主要渠道和主要阵地。”1995年11月，《中国普通高等学校德育大纲（试行）》提出：“马克思主义理论课和思想品德课是对学生系统进行思想政治教育的主渠道和基本环节。”上述文件虽然有“思想政治教育课”和“思想品德课”的不同称谓，但都是指一类课程，而且都强调了“两课”的高校思想政治教育的“主渠道”作用，这是对多年来高校思想政治教育经验的总结，也是对课程功能和作用的概括。
1999年出现“法轮功”问题，由于“对它的政治本质和严重危害，有一段时间没有引起我们足够的警觉”，以至于“酿成1989年那场政治风波以来最严重的政治事件”。“法轮功”问题的出现有着深刻的社会历史原因和复杂的国际背景，充分说明了“思想领域的矛盾和斗争错综复杂，有时还表现得相当激烈。思想领域的阵地马克思主义不去占领，非马克思主义和反马克思主义的东西就必然会去占领”[34]，凸显了坚持物质文明和精神文明“两手抓、两手都要硬”的重要性。“法轮功”不仅破坏社会稳定，又在理想、信念、人生观、价值观等方面腐蚀、毒害青年学生。在与“法轮功”的斗争中，高等学校守土有责，这是由我国教育的社会主义性质和根本任务决定的，而在加强马克思主义唯物论和无神论教育的重要性方面，思想政治理论课发挥着不可替代的作用。
高度重视思想政治工作，是我们党的优良传统和政治优势。在新的历史时期切实加强和改进思想政治工作，重视高校思想政治理论课的建设和改革，充分发挥其主渠道的作用，是一项重要而紧迫的任务。