诊断及鉴别诊断
（一）诊断
1．亚急性或慢性起病
亚急性或慢性起病的头痛患者，同时伴有低热、恶心、呕吐和脑膜刺激征等脑膜炎症状，若有养鸽和鸽粪接触史者，更应该怀疑。
2．腰椎穿刺检查
腰椎穿刺检查提示有颅内压明显增高，脑脊液常规和生化检查证实为脑膜炎症改变（特征改变为压力明显增高，糖明显降低），脑脊液病原学检查是确诊指征，真菌涂片、培养发现大量带有荚膜的新型隐球菌，乳胶凝集试验提示荚膜抗原阳性。
3．头颅CT、MRI检查
头颅CT、MRI检查可发现脑实质内散在的局限性炎性病灶或广泛的脑膜增强反应。
4．其他
若患有全身慢性消耗性疾病、免疫功能损害的疾病或长期使用免疫抑制剂的患者，在病程中出现发热、头痛和脑膜刺激征，经给予广谱抗生素、抗病毒和抗结核药物治疗后，临床症状无明显改善者，应反复多次腰椎穿刺，寻找新型隐球菌证据。(https://www.daowen.com)
（二）鉴别诊断
新型隐球菌性脑膜炎早期诊断较困难。结核性脑膜炎、病毒性脑膜炎、癌性脑膜病及狼疮脑病有类似病程，且脑脊液改变均呈非化脓性改变，是鉴别诊断的重点。
1．结核性脑膜炎
由结核分枝杆菌引起的脑脊膜的急性或亚急性非化脓性炎症。少数为慢性起病。临床表现为低热、头痛、呕吐和脑膜刺激征，体格检查可有意识障碍、脑膜刺激征、脑神经损害、肢体瘫痪以及视盘水肿等。肺部可出现病灶。脑脊液早期呈单核细胞增多为主的炎性改变。生化检查葡萄糖和氯化物明显降低。脑脊液抗酸染色查到结核分枝杆菌或结核特异性抗体检查阳性。抗结核试验治疗1～2周，可使临床症状明显改善。起病初期结核性脑膜炎与新型隐球菌性脑膜炎在临床表现、影像学检查和脑脊液检查相似，难以鉴别。但新型隐球菌性脑膜炎患者的发热程度低，一般不超过38.5℃。部分患者无发热。新型隐球菌性脑膜炎患者颅内高压的表现比结核性脑膜炎明显，头痛剧烈，其剧烈程度与发热程度不相符合。半数以上患者出现视神经盘水肿，常因显著颅内高压而导致脑疝。而结核性脑膜炎患者均有发热，多在39℃以上，常伴全身中毒症状。视神经盘水肿及脑疝的发生率低。结核性脑膜炎的影像学表现主要是脑池的狭窄、闭塞及脑膜强化，脑积水为中至重度。而新型隐球菌性脑膜炎主要以弥漫性脑肿胀为主，脑积水仅为轻度，因此认为早期即有中至重度脑积水的脑膜炎患者结合脑池的变化应警惕结核性脑膜炎。当临床难以鉴别时，常选用抗结核治疗。抗结核治疗2周症状和脑脊液无明显好转时，必须反复腰椎穿刺或小脑延髓池穿刺涂片找隐球菌并进行真菌培养，寻找病原学证据。
2．癌性脑膜病
癌性脑膜病又称脑膜转移瘤，为恶性肿瘤经血行转移、脑脊液种植播散或直接侵犯而累及脑膜的一种严重疾病，部分患者可能以癌性脑膜病为恶性肿瘤的首发症状。年龄＞35岁，以急性、亚急性或慢性起病，表现为突发剧烈头痛、恶心、呕吐和脑膜刺激征。腰椎穿刺脑脊液压力明显增高，可有细胞数和蛋白含量增高，合并葡萄糖和氯化物降低，临床容易与新型隐球菌性脑膜炎混淆。癌性脑膜病重点依靠头颅CT和MRI等影像学检查，注射对比剂后可见大脑凸面、大脑镰及天幕脑膜结节型和弥漫线型强化，同时存在为癌性脑膜病最具特征性的影像表现。肿瘤细胞学检查阳性可明确临床诊断。以头痛起病者，有脑膜刺激征而无发热，脑脊液常规、生化改变类似非化脓性脑膜炎，脑脊液病原学无支持点，抗结核及抗真菌治疗无效者，头部CT和MRI无异常而脑脊液肿瘤标志物增高者，增强MRI有明显脑膜强化，不能用其他疾病解释者要高度怀疑本病。要积极进行头部增强MRI检查，反复腰椎穿刺脑脊液找癌细胞，血、脑脊液肿瘤标志物检测，同时要进行胸部放射学检查，腹部超声检查，对女性患者需进行乳腺及盆腔生殖器的检查，寻找原发灶。
3．病毒性脑膜炎
多呈急性起病，出现以脑膜刺激症状为主的临床表现，脑脊液检查淋巴细胞轻至中度增多，需排除其他疾病后可做出该病的临床诊断。确诊有赖于从脑脊液中分离出病毒或PCR检查的阳性结果。因为是良性自限性病程，绝大多数病毒性脑膜炎实际上没有必要做出确切的病原诊断。