增加经费投入 培养创新能力
学位论文工作是培养研究生运用所学基础理论和专业知识从事科学研究能力的重要环节，也是培养研究生具有创新精神、严谨治学态度和科学作风的重要途径。
研究生学位论文的完成离不开充足的科研经费和良好的实验条件。在调查研究生完成学位论文遇到的最大困难时，文科管理（40.5%）研究生强调的是“培养经费不足”，理工科（28.5%）和医药卫生类（43.2%）研究生认为最大的困难是“实验条件差”（表4
16）。
表4
16 学位论文过程中研究生遇到的困难
研究生培养经费不足解决的根本出路在于建立合理的研究生教育成本分担机制。我校在理顺非定向、定向、委培、自筹经费等各类研究生经费收支管理的基础上，结合各学科实际需要，于2001年增加了下拨到二级学院硕士和博士研究生的培养经费，文科管理类增加到1 200元/人·年和2 000元/人·年；理工科和医药卫生类增加到1 500元/人·年和2 600元/人·年。
自教育部启动“研究生教育创新工程”以来，为提高研究生培养质量，推进研究生教育创新，我校加大了研究生教育的经费投入力度，以研究生学术、实践和创新能力培养为核心，在全校范围构建了若干以研究生为主体的科研创新平台。
（一）设立科研创新基金(https://www.daowen.com)
2001年，我校设立了每年100万元的“研究生科研创新基金”，主要用于资助在校博士生的优秀科研项目，采取课题招标的形式，对博士生申报的科研创新项目，按优博论文风险选题、优博论文培育、优博论文后续研究、研究生创业种子等不同类型，由专家小组评审后择优资助。如2004年共资助了55项优秀博士学位论文培育、13项研究生创业种子和5项优秀博士学位论文风险选题项目。
从1998年以来的6届全国百篇优秀博士学位论文评选中，我校送选的优秀博士学位论文均以优良成绩名列前茅，目前已有33篇博士学位论文入选，入选总数全国排名第三。
（二）构建资源共享体系
为提高研究生尤其是博士生的科研创新能力，我校高度重视研究生开放实验室、交叉学科研究生培养平台等资源共享体系的构建。2003年建成了面向文科管理和理工科研究生的教育部研究生教育创新工程项目“金融数学开放实验室”，根据“985二期”计划中重点建设若干个研究生多学科综合开放实验中心的要求，2004年又下拨启动经费各30万元，组建了面向理科和医科研究生的“生物信息学”和“数字医学”两个研究生创新开放实验室。
（三）承办博士学术论坛
博士学术论坛也是教育部“研究生教育创新工程”的一项重要内容，为广大博士生提供了一个感悟学术魅力、开拓学术视野、提升创新能力的学术交流平台。自2003年10月首届论坛在清华大学举行以来，我校已积极组织博士生（88篇论文）参加了由7所不同高校举办的全国博士生学术论坛，其中有38篇论文在学术论坛上大会宣读。2004年4月我校启动了“复旦博士生学术论坛”，前后共举办了管理学院、国关学院、医学院等八期学术论坛，为2005年我校百年校庆时承办“第三届全国博士生学术论坛”奠定了厚实基础。