实证主义和非实证主义方法论的对立实际上是对“什么是科学”的认识的差别。迄今为止,对于社会科学是否是科学已经不是一个问题,绝大多数学者都认为社会科学也是科学。但是在什么意义上理解“科学”还是有不同的看法,即面对社会现象和自然现象之间的差异性,能否完全照搬自然科学的研究方法来研究社会现象,甚至对于什么是“事实”等问题的认识还存在分歧,其中最为突出的是对“价值中立”或“价值判断”的认识。