14.4 讨论与展望

14.4 讨论与展望

Sci2工具是使用OSGi/CIShell框架的几个工具之一(Börner,2011,2014)。其他工具包括:Network Workbench(NWB),用来进行高级网络分析及可视化(http://nmb.cns.iu.edu);流行病学工具EpiC,支持建模和实时数据分析,并提供与R统计包的接口(http://epic.cns.iu.edu);TexTrend,用来进行文本分析(http://textrend.org)(Kampis et al.,2009)。由于采用即插即用式显微镜方法,使得插件能在不同工具间共享,并能允许用户根据特定的研究需求定制该工具。

目前工作的焦点是将智能局部移动(Smart Local Moving,SLM)算法(Waltman,van Eck,2013)整合到Sci2中,使得Sci2能对任意网络文件进行聚类运算(图14.10)。这种算法基于网络中节点的相对链接数检测社区。在未来的开发中,将融合VOSviewer的完全社区检测能力,使用户能设定聚类的粒度水平,减少大型社区的生成,增加小型社区的生成(Van Eck,Waltman,2010)。

另外,Sci2工具可以作为一种网络服务运行,使Sci2能够请求分析和在线可视化,并且能在云端执行大型计算任务。第一个界面很快就会在美国国立卫生研究院的RePORTER网站上开发出来。Sci2作为一种网络服务将以完全支持创建的方式对外发布,因此用户可以自己在网络上创建和部署Sci2。此外,为电脑桌面开发的算法已经与在线版本兼容。理想的情况是,用户可以使用结合Sci2在线服务功能的工作流跟踪器去创建可以读入数据并输出可视化结果的网络应用。☞

图14.10 Sci2菜单:展示SLM社区检测算法

总结

感谢Vincent Lariviere编译出隶属机构最多的前10000位物理学家数据集,感谢Robort P.Light和Michael P.Ginda对初稿提出了意见。Sci2工具及网站服务由以下诸位研发:Chin Hua Kong、Adam Simpson、Steven Corenflos、Joseph Biberstine、Thomas G.Smith、David M.Coe、Micah W.Linnemeier、Patrick A.Phillips、Chintan Tank、Daniel AKM Halsey、Russell J.Duhon;主要参加者有美国印第安纳大学的Katy Börner和SciTech Strategies公司的Kevin W.Boyack。Sci2使用的Cyberinfrastasaage Shell(http://cishell.org)由印第安纳大学网络科学中心(http://cns.iu.edu)研发;许多算法插件来源于Network Workbench Tool(http://nwb.cns.iu.edu)。

【注释】

[1]Katy Börner,Cyberinfrastructure for Network Science Center,School of Informatics and Computing,Indiana University,1320 E.Tenth Street,Bloomington,IN 47405,USA,E-mail:katy@indiana.edu;D.E.Polley,University Library,Indiana University-Purdue University Indianapolis,755 West Michigan Street,Indianapolis,IN 46292,USA,E-mail:dapolley@iupui.edu.

[2]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Workflow+Tracker。

[3]http://wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/2.6+Sample+Workflows。

[4]http://wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/3.1+Sci2+Algorithms+and+Tools。

[5]http://wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/4.2+Data+Acquisition+and+Preparation。

[6]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Slice+Table+by+Time。

[7]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Burst+Detection。

[8]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Temporal+Bar+Graph。

[9]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Extract+ZIP+Code。

[10]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Aggregate+Data。

[11]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Geocoder。

[12]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Bing+Geocoder。

[13]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Congressional+District+Geocoder。

[14]http://wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/3.2+Additional+Plugins。

[15]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Proportional+Symbol+Map。

[16]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Choropleth+Map。

[17]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Geospatial+Network+Layout+with+Base+Map。

[18]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Lowercase%2C+Tokenize%2C+Stem%2C+and+Stopword+Text。

[19]yoursci2directory/configuration/stopwords.txt。

[20]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Map+of+Science+via+Journals。

[21]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Map+of+Science+via+554+Fields。

[22]http://sci.cns.iu.edu/ucsdmap。

[23]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Reconcile+Journal+Names。

[24]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Extract+Word+Co-Occurrence+Network。

[25]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Extract+Directed+Network。

[26]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Extract+Co-Author+Network。

[27]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Extract+Word+Co-Occurrence+Network。

[28]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Extract+Reference+Co-Occurrence+%28Bibliographic+Coupling%29+Network。

[29]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Extract+Bipartite+Network。

[30]http://wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/3.1+Sci2+Algorithms+and+Tools。

[31]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/PageRank。

[32]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Blondel+Community+Detection。

[33]http://wiki.cns.iu.edu/display/SCI2TUTORIAL/3.2+Additional+Plugins。

[34]http://code.google.com/p/google-refine/。

[35]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Bing+Geocoder。

[36]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Aggregate+Data。

[37]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Reconcile+Journal+Names。

[38]http://wiki.cns.iu.edu/display/CISHELL/Proportional+Symbol+Map。