梅毒螺旋体、沙眼衣原体、淋病奈瑟菌、单核细胞增生性李斯特菌、弓形虫、风疹病毒、巨细胞病毒、疱疹病毒和细小病毒B19等多种微生物以及Q热、登革热、莱姆病和疟疾等罕见感染均可引起散发性流产，至今无证据说明这些感染可导致复发性流产。
在复发性流产中无须常规进行病原体筛查。
