3.5.2 调节服务功能
（1）净化水质
哈巴湖保护区荒漠生态系统通过土壤渗滤、养分吸收和有害物质吸附等方式，每年可净化大气降水5558.3×104m3，继而提供水质良好的地表水和地下水资源。
在降水形成和下落过程中，可溶性有害气体、重金属离子等进入水体，同时会携带各类粉尘和致病微生物。携带污染物的降水到达土壤后，重金属离子和病原体等可被土壤颗粒吸附，粉尘等可被土壤拦截，养分元素可被植物根系吸收，因而荒漠生态系统具有较强的净化水质作用。
（2）固碳释氧
哈巴湖保护区荒漠生态系统每年可通过乔灌木和土壤固碳1.56×104t，这对于适度降低区域工业生产和居民生活带来的碳排放，促进县域碳中和具有一定作用。
2019 年度，盐池县规模以上工业能源消费量为40.01×104t 标准煤。根据标准煤含碳率（70%）折算，可知2019 年盐池县规模以上工业碳排放量为28.01×104t。宁夏哈巴湖国家级自然保护区荒漠生态系统年固碳量为1.56×104t，等效于2019 年盐池县规模以上工业碳排放量的5.57%。
保护区荒漠生态系统受自然条件所限，降水稀少、蒸发强烈、土壤肥力状况较差，植物生长和有机物积累均较为缓慢，固碳服务功能相对较低。然而，植物固碳作为低投入、长实效的环境友好型固碳方式，是目前推进碳减排和促进碳中和最为重要的途径。因此，尽管防风固沙是半干旱区植被建设的主要目的，但不可忽视的是，固碳作为荒漠生态系统一种附属服务功能，对于未来在本区域开展应对气候变化、推动碳减排等工作具有重要作用。
（3）净化大气
哈巴湖保护区荒漠生态系统每年分别可从大气吸收二氧化硫、氟化物和氮氧化物5156.15 t、195.99 t 和314.69 t，同时每年可滞留大气粉尘61.00×104t。2019 年，宁夏全区工业二氧化硫排放总量为30.81×104t、氮氧化物排放总量为32.03×104t。保护区荒漠生态系统可从大气吸收二氧化硫和氮氧化物的能力，相当于宁夏全区工业二氧化硫和氮氧化物排放量的1.67%和0.10%。
宁夏作为我国重要的能源和煤化工基地，向大气排放出大量的有害气体和粉尘，致使部分区域空气质量相对较差，人民生产生活受到极大影响。尽管保护区荒漠生态系统吸收大气污染物的数量比较有限，但是其在改善周边区域大气环境质量方面具有重要作用，为居民健康生活和高效生产创造条件，这也是保护区与周边社区开展共管共享制度探索的重要基础。
（4）防风固沙
哈巴湖保护区荒漠生态系统的区域防护功能，可使牧草和农作物年产量分别增加11625.01 t 和5651.89 t。同时，保护区荒漠生态系统每年可固沙361.58×104t。
宁夏作为我国土壤侵蚀严重的省区之一，水土流失面积1.61×104km2（水力侵蚀面积1.10×104km2、风力侵蚀面积0.51×104km2），占全区总面积的24.29%。宁夏全区水力侵蚀面积的一半以上为中度及以上侵蚀强度，风力侵蚀面积的近三成为中度以上侵蚀强度。根据预测，宁夏全区土壤年侵蚀量约为10000×104t（牛香等，2017）。根据测算，保护区荒漠生态系统年固沙量，相当于宁夏全区年土壤侵蚀量的3.60%，表明保护区荒漠生态系统在区域土壤侵蚀防控方面具有重要的作用。