地层学意义：弥补了三峡地区古冰川序列的缺陷

公园内长阳古城和王家棚地区保存有新元古代南华纪古冰川遗迹和晚古生代海陆交互相-海相沉积，两者之间夹杂着锰矿层。由于在宜昌莲沱南华系层型剖面上仅发育了上层冰碛层，而缺失了古城组、大塘坡组沉积，因此两套冰碛层和所夹含锰矿层的间冰期沉积同时在清江地质公园里出现，为正确认识我国新元古代气候变化，解释我国南华系（成冰系）两次冰期的时代和全球对比提供了重要证据。该剖面是距今约7亿年地球变成雪球的见证，弥补了三峡地区古冰川序列不足的缺陷。

合子坳震旦系与寒武系界线剖面，清晰展示各类界线的特点，为研究两种不同界线对比，揭示和解决全球寒武系与前寒武系（伊迪卡拉系）界线争论问题提供了证据。香炉石二叠系与三叠系界线剖面清晰，且同时在石柱和崖壁上均有明显发育，为长期以来的二叠系与三叠系界线问题提供了重要资源。

清江支流杨溪河两岸出露有极为完整的寒武纪—奥陶纪地层，为扬子板块不同相区之间奥陶系与寒武系界线划分与对比，以及探索长期以来难以区分的三游洞组与覃家庙组之间的界线问题提供了新的资料。马连溪峡口出露的志留系纱帽组顶部—下二叠统栖霞组剖面，发育有海陆交互相的中泥盆世—早石炭世沉积序列，其与所含的动植物化石在揭示扬子板块和华南盆地中泥盆世—早石炭世地层对比方面具有十分重要的意义。