埃及特种部队强硬“营救”
从降落在卢卡机场的C-130运输机上，首先下来了5名埃及士兵，靠近了被劫持的客机，担任警戒。
由阿蒂亚少将率领的25人的特种部队，是一支专门对付恐怖分子的王牌部队。这支部队曾经在美国接受过训练。其装备精良，不亚于美军。它的番号是战斗777部队。据说这支部队还有3名美国人同行，作技术顾问。
另外，为了防止利比亚的干扰，美国的预警机E-2C和攻击机F/A-18从第6舰队航空母舰“珊瑚海号”上起飞，进入了警戒位置。
在被劫持的客机内，劫机犯再三要求机长起飞，但机长始终没有答应。劫机犯不断地殴打着乘客，惨叫声连连不断。这些情况都被指挥塔监听到了。机长开始认为，解决手段除了突袭之外，别无良策。(https://www.daowen.com)
阿蒂亚少将也在寻找着突袭的时机，少将认为，劫机犯杀害了不少人质，再不能坐视劫机犯杀害抵抗的机长了。少将果断地下达了作战命令。
晚上8点20分，特种部队突进了波音737机。因为刚才从加拉尔机长那儿传出了出入口的门被反锁的情报，特种部队决定从后面的货仓发起进攻。他们施放了烟幕，然后悄悄靠近了飞机的货物装卸口。
飞机内，这时劫机犯头目用手枪对准机长的头，顽强的加拉尔机长迅速拿起紧急逃出时用的手斧，把劫机犯头目劈倒在地，自己幸免一死。
旁边的副机长，当发现货仓门被打开的信号，在显示板上一闪一灭时，急忙打开驾驶室的窗户，把软索梯垂了下去，以便突袭部队登机使用。这时发觉后部有响声的劫机犯，已是惊恐万分。正在这时，突袭部队已炸开货物装卸口冲进机舱，一边投掷发烟弹，一边用自动步枪扫射，刹时间，机舱内硝烟滚滚，枪声大作，火光乱窜，乘客们也哀声连连。
正在待命的警车、消防车、救护车，一齐奔向了波音737。知道特种部队冲上来的劫机犯，向乘客中间投了3枚手榴弹，乘客一个接着一个倒在了血泊中。
▲E-2C预警机
冲上来的埃及士兵向劫机犯开了火。但目标并不明确，无疑是盲目射击，导致大量的乘客死亡。有几名乘客在机场探照灯的照射中，跳出机外，夺路逃命，却被埃及士兵误认为是劫机犯，而向他们的后背开了枪，人们发出了凄惨的哀鸣声。此时飞机也着了火，熊熊烈火燃烧长达几小时，还有不少乘客被封闭在飞机内，逃不出来。
马耳他政府将正在休班的医生、护士全部召集到国立医院，并暂时封锁了机场至医院的通道，供救护车专用，但是据说救护车运送的幸存者只有20人，50多人死亡。
据后来的公布，在飞机上被杀害的只有3人，枪战中死亡者是57人，负伤而接受治疗者是34人。
关于士兵不分青红皂白胡乱射击一事，阿蒂亚少将说：“我的部下只打了6发手枪子弹。”原以为烟幕会使很多人窒息而死，但验尸结果表明，大部分乘客是中弹死亡。两种说法出入很大。这充分说明了情报的不准。
开始时，据说劫机犯全部死亡，但后来又宣布1名劫机犯负伤，被收容在瓦莱塔的医院里，幸存的劫机犯，据说名叫奥马尔·马尔兹基（20岁），持有突尼斯护照，正在康复。
埃及政府强烈要求马耳他政府引渡罪犯，但是，马耳他政府以保护主权为由，拒绝了埃及政府的要求。12月4日，马耳他政府声明说，同埃及政府之间没有引渡罪犯的协定，所以要在国内审判。另外，政府发言人说：“罪犯是3名巴勒斯坦人。”
马耳他政府12月6日又公布：唯一幸存的劫机犯马尔兹基说，他是黎巴嫩出生的巴勒斯坦人，叫阿里·莱萨克，今年22岁，希望去利比亚。据他说，劫机犯同伙是3个人，另外2个持摩洛哥护照，头目在和埃及公安员搏斗中死亡。另有一种说法认为马尔兹基是头目，情报非常矛盾。