三　蛋白质组学

蛋白质组指物种基因组所表达的全套蛋白质，包括细胞以及整个生物体所表达的全部蛋白质。蛋白质组学本质上指的是在大规模水平上研究蛋白质的特征，包括蛋白质的表达水平、翻译后的修饰、蛋白与蛋白相互作用等，由此获得蛋白质水平上的关于疾病发生、细胞代谢等过程的整体而全面的认识，这个概念最早是在1995年提出的。蛋白质组的研究不仅能为生命活动规律提供物质基础，也能为众多种疾病机理的阐明及攻克提供理论根据和解决途径。通过对正常个体及患病个体间的蛋白质组比较分析，我们可以找到某些“疾病特异性的蛋白质分子”，它们可成为新药物设计的分子靶点，或者也会为疾病的早期诊断提供分子标志。确实，那些世界范围内销路最好的药物本身是蛋白质，或者其作用靶点为某种蛋白质分子。因此，蛋白质组学研究不仅是探索生命奥秘的必需，也能为人类健康事业带来巨大利益。

目前，在蛋白质功能方面的研究是极其缺乏的。大部分通过基因组测序而新发现的蛋白质，功能都是未知的，而对那些已知功能的蛋白质而言，它们的功能也大多是通过同源基因功能类推等方法推测出来的。更何况，蛋白质的功能在不同时期、不同条件下变化多端。再者，基因转录成mRNA的种类也因生理或病理条件而异（这就是转录组学研究的一项内容），而蛋白质又是从mRNA翻译而来，蛋白质之间的相互作用因而也错综复杂。因此，蛋白质组学的研究要比基因组学复杂得多。

此外，蛋白质组学是研究所有蛋白质的功能及其相互作用，而非单一蛋白质。

蛋白质组学虽然问世时间不长，但已经在研究细胞的增殖、分化、异常转化、肿瘤形成等方面进行了有力的探索，涉及白血病、乳腺癌、结肠癌、膀胱癌、前列腺癌、肺癌、肾癌和神经母细胞瘤等，鉴定了一批肿瘤相关蛋白质，为肿瘤的早期诊断、药靶的发现、疗效判断和预后提供了重要依据。