1.新型冠状病毒肺炎轻型表现需与其他病毒引起的上呼吸道感染相鉴别。
2.新型冠状病毒肺炎主要与流感病毒、腺病毒、呼吸道合胞病毒等其他已知病毒性肺炎及肺炎支原体感染鉴别，尤其是对疑似病例要尽可能采取快速抗原检测、多重PCR核酸检测等方法，对常见呼吸道病原体进行检测。
3.还要与非感染性疾病，如血管炎、皮肌炎和机化性肺炎等鉴别。
4.儿童患者出现皮疹、黏膜损害时，需与川崎病鉴别。
5.与新型冠状病毒感染者有密切接触者，即便常见呼吸道病原检测阳性，也应及时进行新型冠状病毒病原学检测。
