二、经费改革方面
科技项目经费改革主要是围绕优化资金配置，精心组织项目，支撑现代化产业体系建设的方向开展，主要解决科技项目在研究实施过程中可能会遇到的各方面资金难题。
（一）《云南省科技成果转化奖补资金管理办法》
2020年5月19日，云南省财政厅、云南省科学技术厅发布了《关于印发〈云南省科技成果转化奖补资金管理办法〉〈云南省科技创新券实施管理办法〉〈云南省科技揭榜制实施管理办法〉的通知》。其中《云南省科技成果转化奖补资金管理办法》颁布的目的是进一步鼓励和促进高校、科研院所出让科技成果，企业受让科技成果转化应用，服务机构提供技术转移服务，助推更多的科技成果在我省落地转化。
该办法分为总则、职责和分工、范围和要求、条件和程序、管理和监督、附则等共6章24条。
一是明确了奖补原则和重点。奖补资金按照“聚焦重点、目标导向、讲求绩效、规范透明”的原则进行管理，重点对已取得科技成果，直接进入产业化开发，能较快形成产业规模，促进新型业态形成，显著提升相关产业技术水平和核心竞争力的重大科技成果转化项目。
二是明确了奖补的范围。围绕省委、省政府重点打造的世界一流“绿色能源”“绿色食品”“健康生活目的地”三张牌和“数字云南”建设，以及生物医药和大健康产业、旅游文化产业、信息产业、物流产业、高原特色现代农业、新材料产业、先进装备制造业、食品与消费品加工制造业等重点产业领域实施的科技成果转化。
三是明确了奖补的类型。主要对技术交易类、综合服务类和其他类3种类型的科技成果转化进行奖补。技术交易类包括科技成果出让奖补、科技成果受让奖补、新增产能奖补等；综合服务类包括开展成果转化服务、开展科技成果评价服务、开展技术经理人培训、提供共性技术研发等服务活动奖补等；其他类包括创办科技型企业奖补、首（订）购首台（套）技术装备奖补等。
四是明确了申报条件和程序。要求申报单位必须是云南省内登记注册的企业、高校、科研院所和成果转化综合服务机构。项目按照自愿申报、网上申报、组织评审、公示确认和会议确定的程序进行。
五是明确了管理职责和分工。奖补资金由省财政厅和科技厅按职责分工共同管理。财政厅主要负责预算安排、下达和资金的监管。科技厅主要负责发布申报指南、项目评审、编制预算和绩效评价等任务；办法还明确了项目推荐部门和申报单位的责任。同时对奖补资金不得使用的情况做出了规定，对资金使用、监督管理、绩效评价和奖惩机制等方面作出了具体规定。
（二）《云南省科技计划项目资金管理办法》
2020年11月6日，云南省财政厅、云南省科技厅印发了《云南省科技计划项目资金管理办法》（以下简称《科技项目资金管理办法》），该管理办法的颁布是为进一步规范和加强我省科技计划项目资金的管理，提高财政资金使用效益。
《管理办法》分为总则、管理职责及分工、支持类别与方式、资金支出范围、项目预算编制与评审、项目资金执行与调剂、绩效与监督管理、附则等8章35条。
一是明确了适用范围和支持对象。适用于省级财政预算安排支持省级科技计划（专项、基金等）的项目，以及管理上述资金所需要的科技管理业务费；支持对象为高校、科研院所、企业、新型研发机构、事业单位等。
二是明确了资金管理职责及分工。省财政厅、省科技厅负责研究制定项目资金管理办法，组织项目资金预算编制和绩效管理，并对项目资金使用管理情况进行监督检查。并明确科技项目资金管理流程，包括管理部门职责分工、项目资金的管理、立项流程、项目承担单位职责等内容。
三是明确了支持类别与方式。基础研究计划以前资助方式支持为主；重大科技专项计划、重点研发计划采取前资助或前资助与后补助相结合的方式支持；创新引导与科技型企业培育计划采取前资助、后补助、风险补偿等多种方式支持；科技人才和平台计划采取前资助和后补助等方式支持。部分项目经费使用探索“包干制”改革试点，按照《关于开展部分省级科技计划项目经费使用“包干制”试点工作的通知》执行。
四是明确了资金支出范围。主要明确科技项目资金的支出范围和管理要求等内容。
五是明确了预算编制与评审。按照全面实施预算绩效管理要求，在预算编制环节增加了绩效目标编制要求。明确了项目预算评审包括资金预算、绩效目标评审，与项目技术评审合并进行。明确了项目绩效目标评审包括项目绩效目标完整性、相关性、适当性、可行性评审等四个部分内容。
六是明确了项目资金执行与调剂。项目承担单位、参加单位应加快财政科技资金的预算执行进度，提高资金使用效益。项目资金预算执行需要调剂的，按规定程序办理。
七是明确了绩效与监督管理。项目资金实行绩效目标管理，省科技厅、项目单位按照各自职责，对项目支出预算执行进度和绩效目标实现程度开展“双监控”，对绩效运行监控中发现的问题及时反馈、督促整改、及时纠偏，确保绩效目标如期实现。
（三）《云南省科技金融结合专项资金管理办法》《科技保险险种保费补助实施细则》
2020年11月16日，云南省科技厅印发了《关于印发云南省科技金融结合专项资金管理办法和云南省科技保险险种保费补助资金实施细则的通知》。
《云南省科技金融结合专项资金管理办法》按照科技金融工作新要求、新形势，为进一步优化财政科技资金支出结构，推动科技创新与创业投资、银行信贷、担保、科技保险等各种金融方式深度结合，加速科技型企业成果转化及产业化，推动高质量发展，支撑现代化经济体系建设而修订。修订内容及创新点主要集中在引导科技创业投资、科技贷款担保费补助以及科技贷款风险补助等方面，建立科技创业投资项目跟踪机制、持人才创新创业与引导创业投资有机结合、创新对科技型企业科技贷款担保费补助方式、推广“科创贷＋风险金池”试点经验，完善科技贷款风险补助（补偿）机制。
《云南省科技保险险种保费补助资金实施细则》为充分运用科技保险手段，切实有效分散、分担科技型企业科研经营风险，鼓励科技创新，推动科技成果转化，提升科技型企业自主创新能力进行了修订。修订内容主要包括建立科技保险险种遴选考核机制，提出云南省科技保险险种遴选基本条件，建立定期更新机制及险种推广情况跟踪机制；扩大补助政策支持的科技保险险种类别，将云南省支持科技保险险种类别从9种扩大到16种，引导保险机构及科技保险险种深度融入科技型企业成长全生命周期。较原办法相比，增加项目投资损失保险、营业中断保险、董事会监事会高级管理人员责任保险、雇主责任保险、特殊人员团队意外伤害保险和重大疾病保险、环境污染责任保险、知识产权运用等7个类别；按险种类别分3个档次给予保费支出补助。主要按与研发活动关系紧密性原则，对16种科技保险类别分类引导支持。