南路的两支助攻舰队
在日军的计划里，小泽的第一机动舰队是诱饵，栗田的第一游击部队是突入莱特湾的主攻，配合栗田突击莱特湾的还有志摩清英海军中将指挥的第二游击部队（原第五舰队），栗田从北，志摩从南，对莱特湾展开南北夹击。志摩的第二游击部队和栗田的第一游击部队一样，舰队编成中清一色都是水面舰艇，没有航母，基本没有空中掩护。
之所以要兵分两路，一方面固然是两支舰队分别驻扎在不同地方，另一方面更重要的是，考虑到没有空中掩护，兵分两路表面是为了形成夹击之势，实际上也是为了能够分散美军的空中打击力量，不把鸡蛋全部放在一个篮子里，从最坏处打算，至少能保证一支舰队突破美军拦截突入莱特湾。
而志摩的这支舰队，就是在1944年9月台湾海空战里大摆乌龙，以为美军舰队遭到重创而组织起来用于追击的。后来发现“辉煌”的战果完全是谎报，美军舰队基本没有受到损失，已经出海的志摩舰队只好中途折返，就近返回台湾马公。
▲日本海军“那智”号和“足柄”号重巡洋舰。
日军“捷一号”作战开始后，志摩舰队便于21日离开马公前往布桑加岛的科龙湾加油。同时驻扎在马尼拉的第21驱逐队“若叶”号、“初霜”号和“初春”号3艘驱逐舰也奉命南下，经塔布拉斯海峡，在班乃岛以西海域和志摩舰队会合，加入第二游击部队。但这3艘驱逐舰24日在塞米拉斯群岛附近海域遭到美军飞机空袭，“若叶”号被击沉，“初霜”号负伤，“初春”号只好救起“若叶”号的落水官兵，保护着“初霜”号返回马尼拉湾。这样，给第二游击部队加强驱逐舰兵力的计划也落空了。
扶桑级战列舰
1921年日本从英国得到了金刚级战列巡洋舰的设计图纸，在此基础上进行战列舰化，增加主炮，强化主装甲带，缩短舰身，使之在排水量、航速和主炮火力三方面都成为当时世界第一的“最强的超弩级战列舰”，这就是扶桑级，也是日本自行设计建造的第一代弩级战列舰。
由于在原来金刚级基础上增加了2座双联356毫米主炮，而舰身长度反而比金刚级还要短，这就造成了炮塔分布太过密集，同时舷侧装甲带为了保护炮塔也不得不加长，但是这样一来装甲厚度就只能从356毫米降低到305毫米，而且3号4号炮塔和弹药舱挤占了锅炉舱和轮机舱的空间，就无法容纳下大型锅炉，造成最大航速只有22节。此外，也因为炮塔布置太密集，一旦进行全部主炮一侧齐射的话，射击产生的烟雾和气浪就会对整艘军舰造成巨大冲击，尤其是对观测和指挥都有极大不利影响。正因为扶桑级的问题太突出，所以日本海军先后对扶桑级进行了两次大规模现代化改装，主要是提高航速，加强装甲防护。
太平洋战争爆发后，扶桑级虽然经过了改装，但还是存在舰龄长航速慢的缺陷，所以在接应偷袭珍珠港归来的南云舰队和中途岛海战炮击阿留申群岛之后，就基本退出一线作为训练舰使用。
1942年6月中途岛海战之后，本来曾有计划将扶桑级和伊势级一样改装为航空战列舰，但因为日本造船厂造船资源限制而取消。
直到1944年10月才再次投入战场参加莱特湾海战，最终双双在苏里高海峡被击沉。
同级舰2艘，一号舰“扶桑”号1912年3月开工，1914年3月下水，1915年11月建成。1933年和1935年两次进行了现代化改装。
二号舰“山城”号1913年11月开工，1915年11月下水，1917年3月建成。1935年进行了现代化改装。
经过现代化改装后，标准排水量34 700吨，满载排水量39 150吨。最大航速25节，续航力11 800海里（16节）。武备为6座双联356毫米主炮，8座双联152毫米副炮，4座双联127毫米高炮，8座双联25毫米高炮。
编制舰员1 396人。
▲扶桑级战列舰。
▲第2战队司令官西村祥治海军中将。
只是志摩舰队的实力太单薄了，只有2艘重巡洋舰、1艘轻巡洋舰和4艘驱逐舰。因此丰田副武考虑到隶属于栗田第二舰队的第2战队两艘老式战列舰“扶桑”号和“山城”号，由于这两艘老式战列舰的最大航速只有23节，跟不上栗田舰队的其他战列舰，如果一同行动，必然会拖累栗田舰队的速度，所以干脆把第2战队拉出来，再编入“最上”号重巡洋舰和4艘驱逐舰，单独组成一支舰队，由西村祥治海军中将率领，和志摩舰队一起走苏里高海峡，从南面突入莱特湾。
这样，南路的助攻方向，就有志摩和西村两支舰队，总共2艘战列舰、3艘重巡洋舰、1艘轻巡洋舰和8艘驱逐舰，规模也不算小了。和北路主攻方向的栗田舰队相比，实力上的差距也不至于太悬殊，从吸引美军注意，分散美军拦截的空中力量和水面舰艇的角度，这样规模的舰艇编队对美军来说，也算是有价值的，完全有可能吸引牵制相当部分的美军兵力，再退一步说，如果栗田舰队没能按计划突入莱特湾，只有南路助攻舰队杀入莱特湾，以这样的舰队规模也能给美军以沉重的打击。
但是，南路助攻方向就有两支舰队，既然是执行同样任务，自然需要有统一的指挥。志摩清英和西村祥治都是江田岛海军兵学校39期毕业的，但是志摩的吊床号比西村靠前，晋升少将和中将也都比西村早，按照日本海军不成文的规定，志摩是西村的先任，所以应该是由志摩统一指挥。从两人当时的职务来看，志摩是第五舰队司令官，西村只是第2战队的司令官，职级也是志摩高。
第二游击部队作战序列(https://www.daowen.com)
第二游击部队：司令官志摩清英海军中将
第21战队：司令官志摩清英（兼任）
重巡洋舰2艘：“那智”号、“足柄”号
第1水雷战队：司令官木村昌福海军中将
轻巡洋舰1艘：“阿武隈”号
驱逐舰4艘：“曙”号、“潮”号、“霞”号、“不知火”号
合计：重巡洋舰2艘，轻巡洋舰1艘，驱逐舰4艘
第2战队（第一游击部队第三夜战部队）作战序列
第一游击部队第三部队
第2战队：司令官西村祥治海军中将
战列舰2艘：“山城”号、“扶桑”号
重巡洋舰1艘：“最上”号
第4驱逐队
驱逐舰3艘：“山云”号、“满潮”号、“朝云”号
第27驱逐队
驱逐舰1艘：“时雨”号
合计：战列舰2艘，重巡洋舰1艘，驱逐舰4艘
但问题来了，志摩的舰队实力不如西村，而且西村海军生涯大部分时间都是在基层部队，是在风浪里磨练出来的，所以非常看不起大部分经历都是在机关任职的志摩，并不甘心也不服气接受志摩的指挥。反过来志摩也并不想指挥西村，挑起南路助攻总指挥的重任，因为志摩是个惯打滑头仗的，之前在台湾海空战追击“被重创的美军舰队”时，一发现美军舰队实力完备的迹象就立即发电请示，然后带着舰队放弃了任务撤回马公。如今，对这个自杀式的“海上特攻”行动从心眼里是不认同的，自然也就不会主动去指挥西村。而且后来在苏里高海峡，志摩看到西村舰队遭到重创，意识到美军舰队正严阵以待时，就马上放弃任务撤退了。
同时志摩和西村两人，一个不想指挥，一个不愿被指挥，结果两人各行其是，出现两支执行同样任务的舰队，居然相互不联系不协调，自顾自分头行动的奇特现象。
日军一南一北两路夹击莱特湾的两位舰队指挥官，栗田是出了名的“逃跑的栗田”，志摩又是滑头货，让这样两个将领来指挥一场自杀式的突击行动，还会有几分成功的可能？
进入莱特湾，主要有三条航线：第一条是穿过巴拉巴克海峡，再从苏禄海向东，最后经苏里高海峡进入莱特湾；第二条是从苏禄海向北，经圣贝纳迪诺海峡，再沿萨马岛东岸南下，从东面进入莱特湾；第三条是经巴拉望水道，进入锡布延海，再穿越圣贝纳迪诺海峡，沿萨马岛南下进入莱特湾。
在这三条航线中，第一条航程最短，但却在美军摩罗泰岛岸基航空兵的作战半径内，几乎可以确定刚出航就会被美军发现，随即必然会遭到美军猛烈空袭。第三条航线航程最远，但却在美军岸基航空兵的作战半径之外，遭到美军岸基航空兵空袭的概率最小，但途中的巴拉望水道比较狭窄，一旦遭到潜艇攻击就难以摆脱。而第二条航线的利弊则在第一条和第三条航线之间。
所以，日军决定栗田舰队走第三条航线，虽然航程远了一点，但受美军岸基航空兵的威胁小，安全系数更大一些。志摩和西村则走第二条航线，显然也是带有一点吸引美军注意的味道。日军还规定，如果不能南北两路协调一致同时发起攻击，那么任何一路都可以单独发起攻击。
日军将最北面负责充当诱饵的小泽舰队称为北方部队，从萨马岛方向突入莱特湾的栗田舰队称为中央部队，而从苏里高海峡突入莱特湾的志摩和西村舰队则是南方部队。