陆战队与警备队、防备队
驻于某一地区的特别陆战队多为任务编组，担任岛屿守备、甚少担负机动作战。一些特别陆战队长期驻扎一地或演变为警备队。1939年2月日军发起海南岛作战，海军协助陆军进攻海口的陆战队上陆后改编为第5防备队，又先后改称第15防备队、第15警备队。海军独力进攻三亚、榆林，参加作战的横须贺镇守府第4特别陆战队、佐世保镇守府第8特别陆战队、吴镇守府第6特别陆战队规模都在800人左右，加上随舰行动的临时部队合并组成3000人的登陆部队。占领海南岛后吴镇六特改称第6防备队，同年又改第16防备队，1941年再改第16警备队。1940年又有舞鹤一特调入海南岛。直到日本战败时，第15警备队、第16警备队、横须贺四特、佐世保八特、舞鹤一特一直在海南岛担任驻防、警备任务，合计约9000人。类似还有1937年起驻防南京的吴镇五特相继改为南京基地队、南京防备队、南京警备队。
有的特别陆战队并不长期驻防，如1941年曾有吴镇一特、佐世保一特、舞鹤二特先后进驻海南岛约半年时间返回本土。
关于海军陆战队与警备队组成，日文资料在解释两者的差别时指出：“出于和海军特别根据地队同样的情况，陆战队在进攻作战之后，驻扎于当地成为警备队，构筑工事、并配置一定数量的舰艇以及通信设施，转变为独立的一支警备部队，他已成为和陆战队性质完全不同的部队。（战争）初期的警备队，多数象这样由陆战队改编而来。”
1941年颁发《海军特别根据地队令》，将陆战队纳入特别根据地队序列（但上海特别陆战队始终没有纳入同地的上海特别根据地队，且有3年时间两者兼任），规定以镇守府海兵团为基础编成镇守府陆战队、警备队、防备队用于岛屿守备。陆战队设大队、中队、小队，但这些单位的编成和装备不一，约相当于陆军一个步兵大队或以上，到终战时总计超过260队。此类陆战队、警备队、防备队因主要担任守备，拥有较大口径火炮，如横须贺七特1800人的兵力，拥有120毫米炮8门、80毫米炮16门、75毫米高炮4门。
终战时日本海军存陆战队与特别陆战队54个，特别陆战队名录如下：
上海特别陆战队
吴镇守府第1、2、3、5、6、7、11、12特别陆战队(https://www.daowen.com)
佐世保镇守府第1、2、5、6、11—14、105特别陆战队
横须贺镇守府第2、4、5、6、7、11—14、105特别陆战队
舞鹤镇守府第1、2、3、5、6特别陆战队
大凑警备府第1—3特别陆战队
镇海警备府第1、2特别陆战队
特种兵部队有吴镇一百一特为滑翔机空降部队，佐世保八特为骑兵部队，横须贺一特、横须贺三特为伞兵部队，横须贺十五特为战车部队，横须贺十六特为自行炮兵部队。