治疗原则为选用抗厌氧菌药物，主要有甲硝唑、克林霉素。
1.口服药物：首选甲硝唑400毫克，2次/日，口服，共7日；或克林霉素300毫克，2次/日，连服7日。
2.局部治疗：甲硝唑栓剂，每晚一次，连用7日；或2%克林霉素软胶阴道涂布，每次5克，每晚一次，连用7日，口服药物与局部用药疗效相似，治愈率80%左右。
3.妊娠期细菌性阴道炎的治疗：本病在妊娠期有合并上生殖道感染的可能，多选择口服用药，克林霉素300毫克，2次/日，连服7日。
