理论缺乏系统性，难以联系实际

根据认知主义学习理论来说，应该让学生学习理解学科的基本结构。但是我国研究的现状是：在中国知网上搜索关键词“高校网络思想政治教育”，能找到12万余条结果，说明针对高校网络思想政治教育的各个方面的理论研究已经有很多。但是各个研究都是从某一个侧重点入手，研究与研究之间缺少联系和支持，很难做到系统化地把握全局。理论系统不能建立起来，所有的这些理论都不能连成线、化成面。只有当建立起了理论的结构体系的时候，才能让大学生们对网络思想政治教育既有全局性的认识，又有各个方面各个领域的了解。

行为主义学习理论强调的强化作用未能实现，主要表现在，高校网络思想政治教育研究仅仅在网络这一虚拟的平台上展露拳脚，但是没有与现实中的思想政治教育实践活动进行有效的结合，因此不能更好地发挥强化作用，它的有效性也是没有显现出来的。(https://www.daowen.com)

由于美国等西方国家的计算机网络应用发展得相对普及，目前在国际互联网上英文信息要占到全部流通信息的95%。网络上的内容并不全部都有利于学生的全面发展。而人本主义学习理论要求关注学生的全面发展，但是高校网络思想政治教育研究主要着眼于大学生的自身发展，自己的价值观、人生观、世界观的建立，没有很好地和社会发展、国家大政方针相互联系，缺乏对社会责任的研究，只有当两者结合在一起的时候才能使学生有全面发展的机会。