2006年2月14日，教育部印发《关于同意云南财贸学院更名为云南财经大学的通知》，明确指出“学校由云南省领导和管理，学校发展所需经费由云南省统筹解决”。3月24日，省政府办公厅转发《教育部关于关于同意云南财贸学院更名为云南财经大学的通知》，要求省教育厅指导学校制订建设总体规划，加快建设步伐，提高学校办学质量和办学效益，为全省经济建设和社会发展作出更大贡献。至2021年6月，学校隶属关系没有变更。(https://www.daowen.com)
