当前生态农业发展的主要任务
（一）进一步完善生态农业的基本概念和基本原理
生态农业不仅是新的农业技术与传统经验的结合，更应当是在生态经济学基础上、实现了多种组分在时间与空间上综合了的一种工程技艺。整体的概念、系统的方法、能量流动和物质循环的观点、生态位理论、多样性理论、稳定性理论和可持续性理论，以及环境与经济效益等，许多方面还需要进一步发展；应当进一步开展不同生态农业类型的结构与功能的研究，利用定量分析和模拟手段，并将研究结果在精心挑选的试验站点上，通过长期生态定位观测进行验证；应当对现有生态农业的类型进行全面的调查和综合评价，并在此基础上，建立生态农业的科学分类体系，提出适应不同地区特点的优化设计方案；在尽可能的情况下，利用地理信息系统等现代技术，逐步实现生态农业的合理布局；有必要进一步探索生态农业的评价方法，着重从经济效益、生态效益和社会效益的综合角度进行分析。
（二）不断丰富、完善生态农业的技术体系
生态农业技术体系应包括环境友好技术，不同组分的时空优化组合技术，适宜物种（树木、灌丛、粮食作物、经济作物、饲料作物、牲畜、水产养殖等）的挑选与改良技术，基因工程技术，组织培养技术，以及嫁接技术等各个方面。物种的选择应充分体现更高的生产力、更宽的适应性、更强的抗逆力和更多的用途等。农业耕作方法也是一个值得研究的方面。也就是说，应当在生态农业的实践中，逐步实现常规技术的普及、高新技术的引进和传统技术的改良。从经济效益上来说，生态农业技术应当力求实现单位面积、单位水体、单位时间、单位劳动力数量能够获得最大收益，尽可能避免土地、水体、动植物等农业资产的贬值。
（三）建立面向“两个市场”的新的生态农业生产方式
逐步实现生态农业的结构调整，建立既符合国情与地区特点、又适应国际市场需要的新的生态农业生产方式。未来生态农业结构的调整与发展方向，应当面向世界经济的全球化特点，立足“两种资源”，面向“两个市场”。因此，应当打破学科界限与区域界限，充分利用不同学科专家的知识，着力发展具有优质高效、具有环境保护特点，并且面向国际市场、独具特色的生态农业模式。
（四）建立有利于生态农业发展的组织管理体系
农村改革应当充分考虑生态农业发展的要求，建立一些由科研单位和发展组织参与的专门性企业，促进生态农业的发展。创造性地发展“公司+农户”、“工厂+农户”、“管理部门+技术服务部门+农户+营销部门”等多种模式。另外，还应当建立由不同部门联合的生态农业发展协调机构，甚至在现存机构之下成立一个独立的实体，以使它具有更大而且更为有效的行政权力。
（五）建立促进生态农业发展的政策激励与监督机制
从政策上帮扶、资金上支持、技术上指导、价格上倾斜，以提高农民发展生态农业的积极性。建立生态农业发展的监督机制，真正实现生态农业产品的无害化，应当积极倡导“自助餐式”的生态农业发展模式，使农民能够根据自己的能力和需要，确定生态农业发展的方向和经营策略。另外，必要的监督也是十分重要的，因为在一些地方，并没有真正提供“绿色产品”，在一些生态农业模式中，还存在着不同形式的污染，距离生态农业的内涵还有不小的差距。
（六）强化发展生态农业的能力建设
生态农业的能力建设应当从四个层次上进行：一是决策层的能力建设，需要提高生态农业在促进区域可持续发展重要的认识，以制定促进生态农业发展的适宜政策；二是业务人员的能力建设，使得生态农业的管理人员逐步成为掌握生态农业基本理论、方法，并具有管理技能和所涉及各门学科的通才；三是技术人员的能力建设，通过脱产与不脱产培训，使广大技术人员迅速获得生态农业发展中的最新技术和知识；四是农民的能力建设，要始终牢记农民是生态农业建设的主体，应当对农民、牧民、渔民、樵夫、果民和其他土地与水体的使用者给予适当的支持。通过示范、培训和经验交流，促进生态农业知识和技术的传播。在可能的情况下，充分发挥公共媒体的作用，例如电台、电视、报纸甚至网络等，都将对能力建设起到积极的作用。
积极推进国际合作。从信息与人员交流到合作进行培训与研讨，合作进行研究与开发，都应当进一步得到发展。许多国家政府和国际组织（如联合国粮农组织、发展计划署、环境规划署、教科文组织、联合国大学、国际林业研究机构联合会、国际农林研究中心等），都已经并将会继续在这方面起到积极的作用。