她是重庆的地下工作者，直接在邓颖超领导下工作

1939年1月，中共中央南方局在重庆成立，由周恩来任书记，领导南方各省和地区的地下工作及统一战线工作。同年2月南方局成立妇委，由邓颖超负责。

1940年8月，沈纪云从川大毕业。受党组织安排，沈纪云去重庆曾家岩五十号周公馆找邓颖超大姐接上组织关系，并请求指示。据沈纪云对这一段历史的回忆，邓大姐曾经指示她说：“妇女指导委员会中的共产党员要做好统战工作，争取团结抗日力量。主要是在工厂妥善解决劳资矛盾，双方都要为抗日出力。到工厂去了解双方情况，以工厂服务队面目出现，不能暴露身份，要按照妇女指导委员会规定的宗旨，争取做好教育妇女的工作。”当时，去曾家岩五十号周公馆的社会各界人士很多，邓颖超以公开合法身份做妇女统一战线的工作，并单线联系了一批党与非党干部。沈纪云也经常大大方方地去找邓颖超大姐，并没有什么危险，只是后来邓大姐的工作太忙了，才叫沈纪云和张晓梅同志联系。张晓梅，邓小平同志首任妻子张锡瑗的妹妹，时任中共中央南方局统战委员会委员兼妇女组副组长。沈纪云于1940年9月1日进新运总会妇女指导委员会，在生活指导组担任工厂服务队指导员，一直工作到1942年8月，历时共两年整。这段时间基本上由邓颖超同志和她单独联系，领导她的工作。据沈纪云生前回忆，“1941年以后，有一段时间，我也和张晓梅同志有过联系。不过，我还是在邓颖超同志的直接领导下工作的。”新运总会妇女指导委员会，全称为新生活运动促进总会妇女指导委员会，宋美龄曾经担任指导长。中共南方局在妇女指导委员会内部安排秘密的共产党员或爱国进步青年，宣传党的主张，团结、培训、组织妇女干部和群众，推动抗日工作。

沈纪云担任工厂服务队指导员，主要是在重庆的企业中开展女工教育，举办识字班（扫盲）、文化班（小学程度）、读书会（初中程度）。开展活跃业余生活和的体育文化娱乐活动；组织歌咏队，办壁报、球队、话剧组，宣传民主进步与抗日救亡；维护女工的权益，设法改善女工的生活福利，向厂方争取改善伙食；改善对病号的医护待遇，争取工人定期休假、外出等，也调解工人中间的纠纷。工厂服务队发展进步力量，争取中间群众，为重庆工人运动培育了革命的土壤。

由于工厂服务队是妇指会的派出机构，指导长是宋美龄，因此沈纪云的工作是光明正大的，但是国民党也处处提防着她，她必须善于隐蔽自己的真实身份，与工厂服务队中的国民党骨干进行周旋。有时候，混在企业里的国民党分子还偷偷摸摸地检查沈纪云的提包，所以斗争也比较复杂。

1942年夏天，经党组织同意，沈纪云去上海工作。后又回大西南，和丈夫卢维权在云南玉溪中学执教。新中国成立后，她长期坚守教学第一线，担任重庆合江一中的校长。沈纪云的爱人卢维权，毕业于暨南大学化学系，是一位化学家，曾任重庆合成化工厂合成材料研究所所长，长期从事化学合成工艺研究。