核酸酶的抑制和抑制剂
核酸提取过程中对核酸酶的抑制是关键，不同来源的核酸酶，其专一性、作用方式都有所不同，因此应根据降解核酸的类型选择不同的核酸酶抑制剂。按抑制核酸的类型不同，核酸酶抑制剂可以分为两大类。
1.DNA酶（DNase）抑制剂
DNase比较容易失活，其活性需要Mg2+、Ca2+等金属二价离子激活，加入少量金属离子螯合剂，如0.01 mol/L的EDTA或柠檬酸钠就可以让DNase基本失活。此外，表面活性剂、去垢剂等蛋白变性剂也可使DNase失活，常用于提取DNA的有十二烷基硫酸钠（SDS）和十六烷基三甲基溴化铵（CTAB）。
SDS能使蛋白质变性，解聚细胞中的核蛋白，并与变性蛋白结合成带负电荷的复合物，该复合物在高盐溶液中形成沉淀。
CTAB是一种阳离子去污剂，在DNA提取中，其作用是使蛋白质变性，让DNA被释放出来。CTAB能与核酸形成复合物，该复合物可溶，能稳定存在于高盐浓度下（＞0.7 mmol/L NaCl），但在低盐浓度（如0.1～0.5 mmol/L NaCl）下，CTAB核酸复合物就因溶解度降低而沉淀，而大部分的蛋白质及多糖等仍溶解于溶液中，通过有机溶剂抽提，去除蛋白、多糖、酚类等杂质后，加入乙醇沉淀即可使核酸分离出来。因此在利用CTAB法提取DNA时，要用NaCl提供一个高盐环境，使DNP充分溶解，在液体环境中，CTAB同时溶解细胞膜，并结合核酸，使核酸便于分离。经离心弃上清液后，CTAB—核酸复合物用70%～75%酒精浸泡可洗脱掉CTAB，再通过氯仿/异戊醇（24∶1）抽提去除蛋白质、多糖、色素等来纯化DNA，最后经异丙醇或乙醇等DNA沉淀剂将DNA沉淀分离出来。
2.RNA酶（RNase）抑制剂
RNase分布广泛，极易污染样品，而且耐高温、耐酸、耐碱，不宜失活。RNase的抑制和失活是RNA提取的关键。
常用的RNase抑制剂有：皂土、焦磷酸二乙酯（DEPC）、肝素、复合硅酸盐（Iacaloid）、RNase阻抑蛋白（RNasin）、氧钒核糖核苷复合物（vanadyl-ribonucleosidecomplex，VRC）及一些强烈的蛋白酶变性剂，如胍盐、氯化锂等。
DEPC是一种强烈但不彻底的RNase抑制剂，它通过与蛋白质中的组氨酸的咪唑环结合，使蛋白质变性，从而抑制酶的活性。
异硫氰酸胍目前被认为是最有效的RNase抑制剂之一，异硫氰酸胍有破坏细胞结构、能使核酸从核蛋白中解离出来，并对RNase有强烈的变性作用。异硫氰酸胍与β-巯基乙醇（破坏蛋白质的二硫键）合用可使RNase被极度抑制。盐酸胍有时也用作RNase抑制剂，但它是一个核酸酶的强抑制剂，并不是一种足够强的变性剂，可以完整地将RNA从富含RNase的组织中提取出来。
氧钒核糖核苷复合物是由氧钒（Ⅳ）离子和4种核糖核苷中的任意一种所形成的复合物，都是过渡态类似物，能与多种RNase结合并几乎百分之百地抑制RNase的活性。这4种氧钒核糖核苷复合物可加入完整细胞中，在RNA提取和纯化的所有过程中，其使用浓度都是10 mmol/L。所得到的mRNA可直接在硅卵母细胞中进行翻译，并能作为某些细胞外酶促反应（如mRNA反转录）的模板。然而氧钒核糖核苷复合物会强烈抑制mRNA在无细胞体系中的翻译，因此必须用苯酚多次提取以除之。
RNase的蛋白质抑制剂（RNasin）是从大鼠肝或人胎盘中提取得来的酸性糖蛋白，是RNase的一种非竞争性抑制剂，可以和多种RNase结合，使其失活。
Macaloid（硅藻土）是一种黏土，很多年前就发现它能吸附RNase，用缓冲液将其制成浆液，以0.015%（m/V）的终浓度溶解细胞。这种黏土随同它所吸附的RNase可在后续的RNA纯化过程中（如酚抽提后）经离心去除。