政界分化组合
执政时间仅有8个月的细川首相在任期间也积极开展外交活动。俄罗斯总统叶利钦在1993年10月11日访问日本，在与细川首相的会谈中对解决北方四岛问题及缔结日俄和平条约表示积极态度。同年11月6日，细川首相访问韩国与金泳三总统会谈，并作为“加害者”对过去战争及殖民主义统治表示“反省与道歉”。同年12月13日，细川首相决定部分开放大米国内市场，两天后《关贸总协定》达成“乌拉圭回合”的最终协议。
尽管1993年7月东京发达国家首脑会议时宫泽首相与美国总统克林顿约定在6个月内就美国商品在日本市场占有比例的“数值目标”达成协议，但1994年2月细川首相访美时因拒绝“数值目标”导致谈判破裂。细川首相反对管理式贸易，并在记者招待会上表示“日美已经是经常可以说‘不’的成熟大人关系”。 (22) 虽然日本舆论支持细川首相的态度，但美国政府迅速表示采取各种手段对日制裁，并暗示在手机、半导体、汽车零部件等领域实施报复性措施。作为连锁反应，日元急剧升值，日本股票市场平均股价骤然下跌。
1994年3月19日，日本首相细川护熙访问中国。在历史问题上，细川首相表示“对过去由于我国的侵略行为和殖民统治而给亚洲各国民带来了难以忍受的苦难表示深刻的反省和道歉。日本将在对过去历史反省的基础上，为与中国建立面向未来的日中关系而进一步努力”，重申日本将继续支持中国恢复关贸总协定缔约国地位方面的努力。在第四批日元贷款问题上，细川首相表示已指示日本有关部门要提出一个能够为今后的中日友好合作做出贡献的金额。在细川首相访华期间，中日两国政府签署了《环境保护合作协定》。
尽管第129届通常国会在1994年1月31日召集，但因改造内阁风波以及能否以斡旋受贿嫌疑逮捕现职国会议员，国会出现混乱，难以进行预算方案的审议。尽管前建设大臣、自民党众议员中村喜四郎在3月11日被捕，但细川首相本人的政治资金问题又成为在野党追究的对象。其后日本共产党议员追究细川首相以岳父的名义购买NTT股票，其抵押贷款是细川首相在东京的住宅，购买该住宅的费用又涉及佐川快件公司。自民党要求传唤细川首相的原秘书，并专门设置了“细川首相疑惑调查特别委员会”，并组成调查团到熊本县深入调查。4月8日，细川首相在召集的政府执政党代表者会议上表示辞职。
细川首相辞职后使联合政权分裂为新生党、公明党、日本新党与社会党、民社党、先驱新党两个集团，包括自民党在内，各党围绕后任首相展开联合工作。自民党因政治改革相关法案已经出现鸠山邦夫、西冈武夫等离党者，并组成以西冈为代表的“改革之会”。渡边美智雄在细川辞职后也准备脱离自民党组成联合政权，并在4月8日秘密会见小泽一郎，甚至在17日发表脱党声明，但因难以达到小泽提出“率领50名自民党议员参加联合政权”的目标，不得不在19日放弃脱离自民党计划。但在此期间，自民党出现10多名离党者，并组成以鹿野道彦为首的“新党未来”、以柿泽弘治为首的自由党。
在16日召集的七党派联合执政党新政策协议会上，新生党提出了针对朝鲜问题的有事立法、提高消费税等间接税税率、维持《日美安全保障条约》、日美韩合作对应朝鲜核武器研制嫌疑问题等社会党难以接受的政策。在社会党内部久保亘派系、支持社会党工会组织的压力下，以村山富市委员长为中心的社会党领导机构决定有条件地接受其政策，继续维持联合政权框架， (23) 同时支持新生党代表羽田孜为下一人首相候选人。
4月25日举行众参两院全体会议指名选举首相，在众议院羽田孜获得275票，河野洋平获得207票，不破哲三获得15票，弃权者6票；在参议院羽田孜获得127票，河野洋平获得95票，不破哲三获得11票，弃权者13票。羽田当选为首相，但在组阁过程中又起风波。在小泽一郎的策划下，国会指名选举首相后立即向众议院提出由新生党、日本新党、民社党、自由党、改革之会组成的统一会派“改新”申请。社会党不仅完全被排除在外，而且没有参与其过程，直到晚上在首相官邸召开联合执政党党首会谈时才得知此事，党内全体一致决定退出联合政权。羽田孜首相劝说社会党回归联合政权的工作未能成功，直到28日才组成内阁。四分之三的内阁职务由新生党、公明党担任。共同通信社进行的紧急舆论调查显示，羽田内阁的支持率为51.6%。 (24)
同年5月5日，永野茂门法务大臣在接受《每日新闻》采访时发表言论说：“将太平洋战争看做侵略战争是错误的，南京大屠杀事件是捏造的。”结果引起国内外强烈的批判，他被迫在第二天会见记者表示“我过去对历史的发言是不恰当的”，撤回其发言。“南京大屠杀是不能否认的事实。”尽管如此，正在出访欧洲国家的羽田首相还是任命民社党成员接任法务大臣。
1994年度政府预算方案终于在同年6月8日通过众议院的审议，政局的焦点转向对羽田内阁不信任案。自民党试图劝说社会党、先驱新党共同提出不信任案。武村正义持不反对态度，但社会党在6月22日在执政伙伴的选择上出现犹豫。在工会组织的压力下，社会党表示羽田内阁辞职后再组成联合政权或在政策协议的基础上社会党重新参加联合政权。6月23日，自民党向众议院提出内阁不信任案，社会党赞成不信任案，羽田内阁在25日全体辞职。
在下任政权的组成上，社会党成为协议的中心。村山委员长提出尊重宪法理念、与自卫队不同的组织参加联合国维持和平活动、和平解决朝鲜问题、在国民理解的基础上提高间接税率等政策主张。 (25) 先驱新党表示赞成社会党的政策，并支持以村山为首相的联合政权。自民党表示接受社会党与先驱新党的政策，并推荐村山为首相。结果，在6月29日举行的国会举行指名选举首相中村山当选。
6月30日，社会党、自民党、先驱新党联合政权——村山内阁成立，其中自民党总裁河野洋平担任副首相兼外务大臣，先驱新党武村正义担任大藏大臣等，内阁成员自民党13名，社会党5名，先驱新党2名。在众议院，自民党223席，社会党70席，先驱新党13席，合计306席，居稳定多数议席。7月8日，村山首相参加了在意大利那波里举行的发达国家首脑会议，在与美国总统克林顿会谈时表示坚持日美安保条约。
在7月18日召集的临时国会上，村山首相明确表示“自卫队符合宪法精神”“《日美安全保障条约》是必要的”，承认“在学校指导升国旗、唱国歌”等，大幅度转换了社会党的政策。尽管社会党内部对政策转换出现许多反对的声音，但社会党在7月28日召开中央执行委员会会议，通过《我党面临当前政局的基本态势》文件，支持村山委员长的政策转换。
同年8月12日，“选区划分审议会”提出小选区划分方案，国会在11月21日通过《选区划分法案》。为应付新选举制度下的大选，在小泽一郎的策划下，首先在1994年9月由新生党、日本新党、公明党等在野党的187名国会议员组成一个联合会派“改革”，同时成立一个“新党筹备会”。12月10日，由新生党、公明党、日本新党、民社党、自由党、未来新党、高志会、改革之会、自由之会等9个党派组成新进党，拥有国会议员214名，其中拥有众议院议员178名，参议院议员36名。该党提出“坚持不懈的改革”“负责任的政治”等口号，党首为海部俊树前首相，干事长为小泽一郎。