村山富市政权
1995年1月6日，以山花贞夫社会党前委员长任会长的“社会民主联合”为中心组成新党筹备会。17日，24名社会党国会议员向社会党书记长久保亘提出退党申请书，但同一天发生7级的阪神大地震，以社会党为中心的政权全力处理震灾，其申请书搁置起来，组织新党的计划未能实现。
1995年1月17日清晨5时46分，以大阪、神户为中心的大城市圈发生大地震，造成6430人死亡、3人下落不明、43782人受伤，另外有24.8万栋房屋烧毁，受害者达到44.6万个家庭。当天村山内阁派遣以小泽洁国土厅长官为团长的调查团到当地，村山首相也在19日视察了受灾地区，并着手制定紧急特别立法，但仍遭到社会舆论的批判，认为政府在出动自卫队、救济受灾者、运输物资、收集信息等方面反应迟缓。例如设置以村山首相为本部长的紧急对策本部是在19日，在当地设置对策本部是在21日，其主要原因是未能将准确把握事态的信息及时传达到首相官邸。 (32) 村山内阁一方面决定强化危机管理体制，即在大规模灾害发生时迅速收集信息并尽快传达到首相官邸，同时修改《灾害对策基本法》及制定震灾关系新法，减免受灾者的所得税，提高国家补助金在修复事业中的比例等。
同年3月20日早上8时多，新兴宗教“奥姆真理教”在东京最繁忙的三条地铁线15个车站散播毒气，造成12人死亡、5500人受伤。村山内阁10时指示警视厅成立紧急对策本部，并立即向全日本公共运输机构发出强行检查危险物品的命令。村山首相也发表公开讲话，呼吁国民揭发罪犯，并表示国家对死伤者进行适当补偿。警察突击搜查了奥姆真理教在日本各地的设施，并找到制造毒气的证据，陆续逮捕了包括教团首领麻原彰晃在内的主要干部，分别以杀人罪及杀人未遂罪给予起诉，检察机关要求东京地方法院解散该宗教团体。与此同时，《宗教法人法》通过国会的修改，其主要内容为文部省一元化管理宗教团体，强化宗教团体的信息公开、报告活动等义务。
由于长期对立的社会党与自民党组成联合政权，新进党也未获得国民的认可，因而城市出大量不支持政党的选民。同年7月23日举行参议院选举，投票率仅为44.52%，为历史最低记录。在此次选举中，新进党获得较大胜利，改选议席为19个，但获得40个议席。在比例代表区中获得1250万张选票，得票率为30.8%，超过自民党的1 109万张选票。自民党改选33个议席，但获得46席。社会党再次惨败，在改选的41个议席中仅获得16席，党内甚至出现“村山首相辞职”的声音。
1995年5月2日，村山首相访问中国。在与中国国务院总理李鹏会谈时，村山首相表示：“日本的侵略行为和殖民统治，给中国及其他亚洲国家带来了灾难，对此日本表示深刻的反省。日本愿以‘二战’结束50周年作为新的起点，决心走和平发展的道路，决不当军事大国，并以日中联合声明及和平友好条约为基础，同中国建立长期稳定的友好关系。”5月3日，村山首相在向人民英雄纪念碑敬献花圈之后，参观位于卢沟桥畔的中国人民抗日战争纪念馆，这是日本首相首次来此参观。参观结束后村山首相在留言簿上写道：“正视历史，祈中日友好、永久和平。”
成为执政党并担任首相的社会党希望在第二次世界大战结束50周年之际实现反省战争的国会决议，并要求将日本对“侵略行为”和“殖民地统治”进行深刻反省写入决议中。但在联合执政党的协议会上未能达成一致，最后提交干事长及书记长会议进行交涉，终于在6月6日达成妥协。但自民党内有较强的反对声音，以奥野诚亮为会长的“战后50周年国会议员联盟”在达成妥协之前召开紧急团体会议，表示“坚决不能容忍我国单方面的认罪及反省”。另外在自民党总务会上，也出现“自民党不能失去自己的特色”、反对“出卖自民党灵魂的决议”等言论。 (33)
自民党内也存在不同的观点，例如在对战争的认识既有“是自卫战争，也具有解放白人殖民地侧面”的保守派，也有“对亚洲各国是侵略战争，不是为亚洲独立的解放战争”的自由派。保守派在“日本遗族会”等社会团体的压力下，强烈反对决议中包含对侵略行为反省的行文，但以河野洋平总裁为中心的自民党首脑为维持联合政权，主张尽可能与社会党达成妥协。另一方面，最大的在野党新进党也提出自己的修正案，但执政党没有接受，因而该党拒绝出席众议院全体会议。日本共产党反对该决议，自民党也有70名缺席者，6月9日出席全体会议并赞成决议者只有232人，不到众议院全部议员的半数。 (34)
《接受历史教训再次表达和平决心的决议》内容为：“本院值此战后50年之际对全世界战死者及因战争而牺牲者献上追悼之诚意。同时，追忆世界近代史上有许多殖民统治和侵略行为，认识到我国过去进行的这种行为以及给他国国民、特别是亚洲各国国民带来的苦痛，表示深刻的反省之意。我们必须超越关于过去战争的历史观之不同，谦虚地吸收历史教训，建筑和平的国际社会。本院表明在日本国宪法揭示的持久和平理念之下，同世界各国携手，开拓人类共生之未来的决心。” (35)
同年8月15日，村山首相发表谈话，表示日本“在过去不太遥远的一个时期内，国策错误，走上了战争道路，使国民陷入了存亡危机。由于进行殖民统治和侵略，给许多国家特别是亚洲各国人民造成了巨大损害与痛苦。为避免将来重犯这样的错误，我要面对这一无可怀疑的历史事实，并再次表示深刻反省和由衷的歉意。”
村山政权内部也有不同的声音。8月9日，文部大臣岛村宜伸发表言论说，过去日本发动的战争“是否侵略战争是想法不同的问题”，遭到国内外舆论的批判，岛村大臣被迫道歉；接着在11月8日，韩国《东亚日报》揭露总务厅长官江藤隆美在10月发表“朝鲜殖民地统治合理”的言论，也遭到国内外舆论的批判，被迫在13日辞职。
1995年9月4日，在冲绳发生了三名美军士兵强奸日本小学女生的恶性事件。日本警察要求引渡犯罪嫌疑者，但美军以日美地位协定为借口加以拒绝，冲绳县民举行归还以来最大规模的抗议集会，有8.5万人参加。担心影响到日美安保条约的存在，9月21日美国总统克林顿表示遗憾之意，但冲绳居民掀起要求归还美军基地的运动。28日，冲绳县知事大田昌秀表示拒绝代替土地所有者在向美军提供土地的文件上署名。
日本政府与美国协商修改日美地位协定，在起诉前由日本关押美国犯罪嫌疑者，并设置整理基地的日美“特别行动委员会”。与此同时，村山首相在11月4日与大田知事会谈，决定设置有关基地问题的中央政府和冲绳县协议机构，但大田知事坚持修改日美地位协定，并缩小乃至废除基地，继续拒绝署名。对此，村山首相先是劝说大田知事代理署名，然后命令其代理署名，如果拒绝的话则进行职务执行命令诉讼。12月8日，村山首相起诉拒绝代理署名的大田知事。尽管为平息国内的不满情绪，村山内阁表示整理、缩小美军驻日基地，但日本政府仍然决定了完善防卫力量的新防卫计划大纲，明确维持并强化日美安保体制，在处理大规模灾害及联合国维持和平活动等领域发挥自卫队的较大作用。 (36)
同年10月28日，政府提出包括向受害者提供一次性补助金在内的“水俣病实际认定患者最终解决方案”获得未认定患者团体和昭和电工厂方的同意，从1965年确认新潟水俣病患为工厂排放废水中含水银所致已过去40年，该问题终于得到解决。12月15日，村山首相发表谈话表示“遗憾之意”，并认为应当对受害者的出现和扩大进行直率地反省，同时明确了国家的责任。
1995年11月开始实施大米流通、贩卖自由化的“新粮食法”，即《关于主要粮食需求及稳定价格的法律》，废除了1942年以来的《粮食管理法》。新法律的实施原因一方面是国内粮食流通制度的弊端。1993年9月，农林牧副渔水产省宣布由于低温、多雨、台风等原因，当年大米收获量仅为上一年的74%，只有850万吨，而消费量为995万吨，缺口为145万吨。为此，当时细川内阁决定紧急进口加工用米20万吨和食用米100万吨。本来农林水产省粮食厅针对消费量逐年减少、库存逐年增加、管理成本上升的倾向，进入90年代以后减少库存，结果1992年库存仅有20万吨。
另一方面，在《关贸总协定》乌拉圭回合谈判中，日本接受主席协调方案，即设置6年的关税化缓期执行时间，但负有最低进口的义务。根据有关规定，日本从1995年进口量相当于大米总产量4%的40万吨，每年增加0.8%，到2000年扩大到8%的80万吨。但是，“新粮食法”也存在内外价格平衡问题以及有效管理150万吨库存大米的问题。
为刺激经济恢复景气，村山内阁在1995年9月实施总体规模为14.224万亿日元的“经济对策”，其中公共投资为12.8万亿日元，中小企业对策费1.3万亿日元，同时采取推动土地流动化、缓和政府管制等经济结构改革措施。 (37) 另一方面，由于1990年大藏省采取限制金融机构贷款规模时不包括农林金融机构和住宅金融专门公司，结果农林系统金融机构提供给住宅金融专门公司的贷款余额在1995年达到5.4万亿日元，大多成为不良债权。为处理这些不良债权，村山内阁在1995年12月决定投入6850亿公共资金，并将其编入1996年度的政府预算方案。
在1995年9月举行的自民党总裁选举中，通产大臣桥本龙太郎当选，组成加藤紘一干事长、山崎拓政务调查会长的新一代领导体制。新进党在同年12月举行党首选举，小泽一郎当选。在社会党内部，组成新党的动向不断，9月举行的社会党临时大会决定成立名为“民主联合”的新党，11月成立新党组成准备会，并在12月决定了《新党的理念和政策》《新党党章草案》等。1996年1月19日，社会党举行全国大会，通过了关于基本理念和政策、新党章、新党名等的决议。规定党的性质是“民主主义的共同之家，是社会民主主义者、自由主义势力等各种人群参加，通过共同努力实现幸福的开放型市民政党”，党的基本理念是“创造性地发展日本国宪法规定的主权在民、永久和平、基本人权、国际协调的理念”，新党名为“社会民主党”，党首为村山富市。 (38)