光绪十九年癸巳（1893）四十六岁

是年　 任新加坡总领事。

五月　禀报薛福成称，南洋各岛华民不下百余万人，“虽居外洋已百余年，正朔服色仍守华风，婚姻殡祭，亦沿旧俗，近年来各省赈筹赈防，多捐巨款”。“观其拳拳本国之心，知圣泽之浃洽者深矣”。惟担忧归国“以为长官之查究，胥吏之侵扰，宗党邻里之讹索”，“挟资回国之人，有指为逋逃者，有斥为通番者，有谓其运军火接济海盗者，有谓其贩卖猪仔要结洋匪者，有强取其箱箧肆行瓜分者，有拆毁其屋宇不许建造者，有伪造积年契券籍索逋欠者”，“因是不欲回国”。提出“今欲扫除积弊，必当大张晓谕，申明旧例既停，新章早定，俾民间耳目一新，庶有裨益”。五月十六日，薛成福称“黄遵宪体察既深，见闻较熟。故言之详切如此”。据此奏请申明新章豁除海禁折。七月初十日，朱批军机处奏议。八月初四日军机大臣等遵议申明新章，豁除海禁，恭折具陈。朱批：依议。

六月六日　上薛福成禀称，大小白蜡及石兰峨之吉隆一地，产锡最旺，华人日增，气象方兴未艾，拟请大小白蜡共设副领事一员，吉隆设副领事一员，“可资约束而筹保护”。

遵宪履任新加坡二年患疟久病，初养疴于“章园”；后往槟榔屿，住“竹士居”；亦借居“佘山楼”，并为之题名。

接任新加坡总领事后，以倡导学术文风为己任，将原“会贤社”易名为“图南社”，按月课题，奖励学人。作《晓谕采访节妇示》，“凡我商绅人等，宜各周咨博访，据实直陈，上以邀朝廷绰楔之荣，下以表闾阎彤管之美”。