光绪二十三年丁酉（1897年）五十岁
正月致函前新加坡总督施密斯，详述任总领事时，商人缴存运载烟土的偿税保金经过，以及该款共四万元存于琼商蔡文宝处，其后提交库务司收贮情形，然而，“德国朝廷因闻此等武断之谤故遂递行辞却，不允补充中国驻德大臣”。“所云勒收此税一事，则今尚有公禀存案，可核而知”。
正月至二月间 致函梁鼎芬倾吐使德、英事不成后心情，称“遵宪平生视富贵泪如，于进退亦绰绰，然而此刻胸中抑郁，为平昔所未经”，“居此数月，益觉心灰，译署几作战场，狺狺之吠，直无休日”。
三月 与唐文治、张元济等京师名士于崇效寺观牡丹。又过何翙高谈日本事，并题《象山图》。
三月十日 致汪康年书谈时务报馆章程的重要性，“此馆章程，即是法律”。“章程不善，可以酌改，断不可视章程为若有若无之物”。“宪纵观东西洋各国，谓政体之善，在乎立法、行政歧分为二，窃意此馆当师其意”。
三月二十一日 致汪康年书谓“《日本杂事诗》为初到东瀛时作”，成于光绪五年，“此书寓意尚有与《国志》相乖者，时有删改”。
五月 新授湖南长宝盐法道。
五月三十日 谒户部尚书翁同龢，长谈，重在延德人、练德法。
六月初六日 与日本驻华公使矢野文雄曰：“二十世纪之政体，必英法之共主。”胸中蓄此十数年，未尝一对人言。矢野力加禁诫。
六月十五日 向翁同龢辞行，明日起身，长谈：“第一事开学堂；二事缓海军，急陆军，十五万人已足；三事海军用守不用战。三大可虑：一教案，一流寇，一欧洲战事，有一于此，中国必有瓜分之势。论人才少许可。于晦若、沈子培、姚子良、沈尚能办事。盛杏荪、郑苏戡、梁启超、叶锡勇、杨文骏，并好才。”
六月十六日 出京赴湖南长宝盐法道任。因陈宝箴一再电促，决意不回家，即由沪赴湘。二十六日至沪，七月初往江宁，七月底过湖北，八月入湘。至沪，因主张《时务报》举董事，几与汪康年决裂。登黄鹤楼，有《上黄鹤楼》诗。登过岳阳楼，有《上岳阳楼》诗，诗中有“当心忽压秦头日，画地难分禹迹州”句，注谓：“近见西人势力范围图，竟将长江下游及浙江、湖南指入英吉利属内矣。”又注：“是日有西人登楼者。”抵长沙，吊贾谊宅，有《长沙吊贾谊宅》诗。
八月 原任长宝盐法道李经羲升湖南按察使晋京，遵宪履湘任，即署理湖南按察使。
九月十六日 张之洞致电陈宝箴、黄遵宪，指斥《时务报》第四十册梁启超所作《知耻学会叙》，内有“放巢流彘”一语，“太悖谬”，称“报馆为今日开风气、广见闻、通经济之要端，不可不尽力匡教维持”，令“此册千万勿送”。十七日，陈宝箴复函张之洞谓此册尚未到，“预饬停发，并嘱公度电致卓如，以副盛意”。同日，黄遵宪致函张之洞，“既嘱将此册停派，并一面电卓如改换，或别作刊误，设法补救”，表示以后“所作报文，宪当随时检阅，以仰副宪台厚意”。
九月 谭嗣同等主张设立时务学堂。黄遵宪“甫经到湘，即闻湘中官绅有时务学堂之举”。在陈宝箴、黄遵宪支持下，湖南时务学堂于本月开始筹办。
是年底 拟《湖南保卫局备忘录》，备办之事三十二项。