慢性疾病患者肠道菌群的改变

1.肥胖患者与健康人群肠道菌群差异巨大：与健康人群相比，肥胖患者肠道菌群中有益菌，包括Bifidobacterium、抗炎性Faecalibacterium、产丁酸Ruminococcaceae都显著降低；而Bacillus及其他潜在机会性致病菌如Fusobacterium、Escherichia-Shigella显著增加。此外，体重介于健康和肥胖患者之间的超重人群，其肠道菌群结构改变频率介于健康和肥胖患者之中，表明与肥胖相关的肠道菌群结构随着肥胖进程出现规律性变化。

2.高脂饮食与健康人群的肠道菌群也存在巨大差异：与健康人群相比，高脂饮食人群肠道菌Prevotella、Abiotrophia丰度差异显著。对社区中高脂饮食人群施以微生态法，即在其饮食中添加益生菌的同时进行膳食干预。结果发现微生态干预法能有效改变高脂饮食人群粪便的多样性、结构和丰度，表现为干预后肠道菌群多样性提高，降低某些潜在致病菌的丰度，包括Bacteroides、Fusobacterium、Pseudomonas等，同时增加有益菌的丰度，如Prevotella、Faecalibacterium prausnitzii、Coprococcus和Gemmiger等。

3.发现CRC不同发展阶段患者肠道菌群的规律性变化：通过对CRC患者、腺瘤患者以及正常对照组人群的粪便样本菌群进行全面测序分析，发现CRC和腺瘤患者特异性的菌群谱：在门水平，腺瘤组的厚壁菌门和放线菌门丰度显著降低，而变形菌门和梭杆菌门丰度逐渐增加；属水平鉴定发现67种菌显著变化。CRC组样本中的厚壁菌门和放线菌门的丰度较正常对照组的同样显著降低，而变形菌门、拟杆菌门和梭杆菌门的比例显著低于健康对照组。属水平上CRC组共有148种细菌发生了显著变化。总起来看，本项目发现具有规律性增加特征的中国CRC患者肠道“核心菌群”——具核梭杆菌Fusobacterium nucleatum。

4.发现慢性便秘患者肠道菌群的规律性变化：收集上海市第十人民医院微生态门诊诊断为慢性便秘患者粪便样本，对所有粪便样本进行16S rRNA菌群测序、宏基因组测序及组学分析后发现，与健康人群相比，便秘人群Prevotella_9菌属的丰度较低，Escherichia-Shigella菌属丰度较高，双歧杆菌属中的Bifidobacterium_dentium丰度在健康人群中富集，而Bifidobacterium adolescentis和Bifidobacterium animalis在便秘人群中高度富集。乳酸杆菌属Lactobacillus oris和Lactobacillus reuteri在健康人群中富集。微生态制剂治疗后Faecalibacterium、Prevotella 9、Subdoligranulum、Bacillus等10种菌属丰度较治疗前增高，Bacteroides、Parabacteroides、Alistipes、Escherichia-Shigella、Blautia、Lachnoclostridium、Phascolarctobacterium等11种菌属丰度较治疗前降低。确定慢性便秘患者核心菌群为Escherichia-Shigella、Bacillus、Lactococcus和Faecalibacterium。