吏治实践讲求“灵活”“效率”
吏治是朝廷控制国家、管理国家的基本途径，能否推出有效的吏治措施，直接关系到吏治的效果。由于吏治的对象是社会的方方面面、各行各业，因此，吏治的措施是否得当，关系到社会治理的成败。在吕坤的著述中，提出了自己的吏治主张。[18]
（一）官员尽可能就近升迁
在万历年间，交通工具较为落后。北方地区，马车是主要的交通工具。文中之所以要提到交通工具，是因为官员的升迁事宜同它密切相关。官员从一地升迁到另一地，往往是举家迁移，家人、仆人跟着，财产也要搬走。交通工具必须发挥大的作用，才能满足其搬迁的需求。而很多人和财产搬迁，需要很多交通费用，这样不仅给王朝带来巨大的负担，而且给百姓带来很多苦役。对此，吕坤做了描述：“臣惟百姓之差，驿道为重，而驿道之差，轿扛为重，招募贫民，一日才得银二分耳，一身衣食八口供养取给焉，驿道官常例造册工食循环使费取给焉。”分析吕坤所描述的内容可以得知，官员升迁，驿道事多，百姓差苦，收入甚少，官员得利，朝廷财产遭受损失。面对这些情况，吕坤做了假设：“夫弃妻子而之官，人情之所不堪也。”如果官员升迁搬家，抛弃家人，这样的官员太没有人情了。可眼前的情况是，“携妻子而旅困，圣王之所不忍也”。如果拖家带口，长途搬迁，人困马乏，朝廷的财产要受到损失，皇上对此目不忍视。为此，吕坤提出自己的相关建议。
吕坤提出，官员尽可能就近升迁，搬迁费用才能减少。他把全国分为三个单，他们分别是：南单、中单、北单。如云南、贵州、广州、福建五省为南单；南直隶，浙江、江西、四川、湖广五省为中单；北直隶，山东、山西、河南、陕西五省为北单。全国分为三个区域以后，官员升迁尽可能在本区域内进行。当然，官员升迁京师例外，中部区域可以灵活一些。不同区域间，相邻地区可以升迁，总的原则是，尽可能就近升迁。奏折中有其详细的建议：“三单各自论俸，不得以北单人升南缺，亦不得以南单人升北缺，惟是中单尽可通融，如陕西之于四川，湖广之于广西，四川之于云贵，接壤之区，升迁亦便。”从吕坤所言得知，他身在山西，心系整个王朝，当时身为山西巡抚的吕坤，为明王朝的大事操劳，他的行为实在感人。
官员要尽可能就近升迁，吕坤从原因上做了进一步的论述。他总结了就近升迁的六大好处。其一，节省搬迁中人力、马力的费用开支，即“省驿道夫马供支之累”。其二，免去官员及家人长途跋涉的疲劳。即“免本官长道跋涉之苦”。其三，便于官员早日上任履行职责，即“赴任近而历俸早”。其四，避免官员在异地上任不适水土的现象，即“无水土不习之病”。其五，避免出现同地方百姓交流中的语言障碍。吕坤建议：“南人习南官语，北人习北官语，听讼晓谕，不费词说。”吕坤这一小的建议是否合理，笔者不敢轻易下结论，但如按此建议实施，至少可以消除官员同百姓交流的语言障碍。其六，官员可以减少在路途中消耗的时间，可以把更多的精力投入到自己所做的事中去，即“道路不耽日时，职业不至久旷”。吕坤如此细致地分析，可以说是从全方位的角度进行的。由此可以得知，如果“官员就近升迁”这样的措施被朝廷推出，将有利于百姓，有利于明王朝。
（二）倡导“鲁人治鲁，宋人治宋”
根据多年基层执政经历和历史经验，吕坤明确提出了“地方自我管理”的设想。他认为，今朝的一些地方官员，可以用当地人。大到“总督”，小到县令以下的官，用当地人是可以的。他首先举了一些历史事例来论证。吕坤言：“臣尝考之古人，鲁人为鲁司冠，宋人为宋司城，宗族亲戚皆其所治，未尝有不行之法。汉朱买臣、张镇周皆治其乡人，未尝有可避之嫌。”以上都是地方自我管理成功的一些事例，“鲁人治鲁，宋人治宋”，西汉朱买臣、隋唐张镇周管治家乡都曾获得成功。这些地方官员，他们对其宗族内的人和亲戚管理得很好。这些成功的历史经验，我们应该借鉴。
吕坤在他的奏折中建议：“今总督宣大山西，未尝不用山西人。总督蓟辽保定，未尝不用真定人”。对于州县内职位较低的官员，从外地较远的地方挑选，更没有必要，他继续言：“彼府卫首领州同州判吏目，县丞主簿典史权统于印官，职分于一臂，弹丸郡邑，有何事权，而必须隔省除授，于二三千里之外哉？”在他的建议中，从总督到地方小官，可以大胆地起用当地人，传统的“异地做官”这一模式在有些地域应该打破，不妨使一些地域的吏治方式发生改变，或许有利于该地区的治理。
笔者认为，地方自我管理有不少优点。其一，当地人从小对家乡的方方面面很熟悉。熟悉一个地方的域情民俗，这是治理好一个地方的前提。其二，对于建设自己的家乡来说，当地人进行组织管理，有时责任心更强。其三，在廉洁自律方面，很多百姓无意识地对他监督。其四，宗族、亲戚、家乡人同官员有先天的血缘关系和乡土感情，因此，他们会主动积极地配合他的工作，使他的管理措施能够顺利地实施。当然这种管理方式，一定有其弊端，在其运行的过程中要注意克服。从以上分析可知，吕坤在明万历年间，能打破时代的约束，对“地方自我管理”提出一些明确的建议，说明吕坤高瞻远瞩，是一位具有超时代眼光的政治家。