用于结核分枝杆菌耐药性分子检测的DNA序列

1.利福平耐药（rpoB）　95%的利福平耐药菌株均在rpoB基因的81bp区域（507 ～533位点）发生了突变，尤其是在位点531、526或516。该81 bp区域被称为利福平耐药决定区（RRDR）。利福平耐药可被用作MDR—TB的替代指标，因为对利福平耐药的菌株一般也对异烟肼耐药。虽然各种检测技术均有了很大进步，仍会出现一些漏检或错误结果，因为有2%利福平耐药菌株在RRDR区未发生突变，而且还有一些利福平敏感菌株发生了突变。因此，仍需开展表型药敏试验。

2.异烟肼耐药（katG，inhA，acpM和kasA）　50%～95%异烟肼耐药菌株在KatG基因的315位点发生了单突变。其他基因如inhA，acpM和kasA也与异烟肼耐药相关。多重等位基因特异性PCR和多重PCR可同时测定katG和inhA基因的突变，用于诊断异烟肼耐药。GenoType MTBDRplus不仅可检测rpoB和katG基因突变，还可检测inhA基因突变，用于同时检测异烟肼和利福平耐药。(https://www.daowen.com)

3.氟喹诺酮类耐药（gyrA和gyrB）　60%～90%氟喹诺酮类耐药是由gyrA基因74 ～113位突变引起的，少部分由gyrB基因500 ～538位突变引起。尽管特定的gyrB基因突变会导致不同的耐药水平，有文献报道gyrB基因单独突变也可引起氟喹诺酮类耐药。在gyrA或gyrB基因氟喹诺酮耐药决定区外也存在基因多态性。

4.阿米卡星、卡那霉素和卷曲霉素耐药（rrs和eis）　文献报道，在120株结核分枝杆菌中4种类型的rrs基因突变S2170A （100%）、R2201G （58.3%）、K2202E （66.7%）和K2207（41.7%）位点缺失与阿米卡星、卡那霉素和卷曲霉素耐药相关。eis启动子突变也与上述三种药物耐药相关，但突变频率低于rrs基因。若在检测中纳入eis启动子可提高阿米卡星和卡那霉素耐药检测的灵敏度。基于该理论，GenoType MTBDRsl 2.0纳入了eis启动子以检测XDR—TB。