二、样本处理方法
重要提示:所有操作应严格遵守结核分枝杆菌实验室生物安全相关规定。
(一) VITEK MS分枝杆菌/诺卡菌试剂盒—Ref 415659
1.该试剂盒成分
(1) R1=乙醇(ready to use,70%)(2×25 ml)。
(2) R2=甲酸(ready to use,70%)(4×0.5 ml)。
(3) R3=乙腈(ready to use,100%)(4×0.5 ml)。
(4) RBT=2 ml圆底无色离心管(2×50 units)。
(5) BEAD=含玻璃珠管(2×50 units)。
2.试剂盒未提供但需要的试验材料
(1) 微量离心机:10 000 ~14 000 g。
(2) GENIE 2 Vortex + Mobio adaptor(ref 270677)或珠磨器(Bead beater)。
(3) 生物安全柜。
(4) 微量加样器及加样头。
(5) 涡旋振荡器。
(6) 1 μl接种环(取分枝杆菌用)。
(7) 细胞刷(取嵌入琼脂的诺卡菌用)。
(二) VITEK MS分枝杆菌液体培养基处理试剂盒(Vitek Ms Liquid Mycobacterium Supplemental Kit)—Ref 421564
该试剂盒包括5 ml离心管(2×50 units)和背面安全防护吸水纸(1×250 units)。
(三) 固体培养基分枝杆菌/诺卡菌准备流程
1.对于每种受试微生物,将0.5 ml的R1移入含玻璃珠的试管(BEAD)。
2.对于Mycobacterium,使用1 μl接种环取受试菌并移入试管,然后盖紧。对于NOCARDIA,使用1 μl接种环(一整环)或弯曲型细胞刷(菌株内嵌时用)轻轻从培养基取菌并移入试管,然后盖紧。
3.使用带适配器的涡旋振荡器(最大速度)分散细胞15 min,或使用研磨珠均质器分散细菌5 min。
4.从振荡器或研磨珠均质器上取下试管,并置于室温孵育10 min以完成灭活。
5.使用涡旋振荡器振荡5 ~12 s,并立即使用移液器将悬浮液移入空的2 ml圆底试管(RBT)。注意不要移取任何玻璃珠,丢弃吸管头。
6.以10 000 ~14 000 g的速度离心处理标本2 min,以形成沉淀物。(https://www.daowen.com)
7.使用移液管吸除所有R1上清液。
8.向菌团添加10 μl的R2。使用移液器吹打直到菌团均匀散开或直接通过涡旋振荡器重新悬浮。
9.添加10 μl的R3,并使用涡旋振荡器振荡。
10.以10 000至14 000 g的速度离心处理2 min,以形成沉淀物。
11.对于每种受试微生物,立即将1 μl上清液移到靶板点位上。
12.让每个点位完全晾干。
13.向每个靶板点位添加1 μl的VITEK MS—CHCA基质,每次添加基质都使用新的移液吸管头。让基质完全风干。
(四) 液体培养基分枝杆菌准备流程
注释:在测试仪器鉴定为阳性后的24 ~72 h内,测试阳性BacT/AlERT MP瓶、BACTEC MGIT 960试管(BD)或Versa TREK Myco培养基瓶(Thermo Fisher)。如果瓶子或试管从仪器中取出进行其他测试,继续在培养箱中以35 ~37℃培育直至其在阳性后培育24 ~72 h。
1.使用涡旋振荡器混合瓶子或试管5~10 s,然后立即以无菌方式将3.0 ml培养基从培养瓶移入5 ml CBT。
2.使用带15 ml适配器的吊桶式离心机以3 000 g的速度离心处理标本10 min,以形成沉淀物。
3.将培养基移入废物容器,并在带保护性背板的吸水垫上完全吸干(WIPE)。使用后丢弃垫子,避免接触吸收表面。
4.将500 μl的R1加入5 ml CBT,然后使用移液管轻轻上下混合以重新悬浮颗粒。
5.移入装有玻璃珠(BEAD)的试管中。
6.使用带适配器的涡旋振荡器(最大速度)分散细菌15 min,或使用研磨珠均质器分散细菌5 min。
7.从振荡器或研磨珠均质器上取下试管,并置于室温孵育10 min以完成灭活。
8.使用涡旋振荡器振荡5 ~12 s,并立即使用移液器将悬浮液移入空的2 ml圆底试管(RBT)。注意不要移取任何玻璃珠,丢弃吸管头。
9.以最低14 000 g的速度离心处理标本2 min,以形成沉淀物。
10.使用移液管吸除所有R1上清液。
11.向菌团添加10 μl的R2。使用移液器吹打直到菌团均匀散开或直接通过涡旋振荡器重新悬浮。如果沉淀物不可见,用R2清洗试管两侧,以确保重新悬浮。
12.添加10 μl的R3,并使用涡旋振荡器振荡。
13.以最低14 000 g的速度离心处理2 min。
14.对于每种受试微生物,立即将1 μl上清液移到靶板点位上。
15.让每个点位完全晾干。注意:如果在添加VITEK MS—CHCA前点位未完全晾干,样品最优结晶化可能无法实现,并会潜在干扰VITEK MS结果(无鉴定)。
16.向每个靶板点位添加1 μl的VITEK MS—CHCA基质,每次添加基质都使用新的移液吸管头,让基质完全风干。