并发症有医源性宫内感染、胎盘早剥、胎膜早破、脐带脱垂、羊水栓塞、急性羊膜腔内压升高、子宫破裂、胎心变异、孕妇心力衰竭和呼吸衰竭等。产前多次羊膜腔内灌注生理盐水治疗孕、中晚期羊水过少时可引起早产、自然流产及胎死宫内。经腹羊膜腔穿刺，还可造成母胎损伤，近年来，随着超声技术的发展，操作技术的提高，此并发症大大减少。
虽然羊膜腔内治疗是一项安全、直接、价廉的方法，但也不可忽视其潜在的危险，应严格掌握适应证和禁忌证，及时发现及处理并发症，进一步研究及完善此技术。
