中心实行主任负责制，负责中心的统一管理和资源调配。建立了一套完善的实验教学质量保障体系和运行维护机制，做到了深入、细致、科学、规范的管理。仪器设备使用管理制度健全，大型仪器设备登记使用。固定资产账、物相符率达100%，设备完好率达90%以上。
中心由实验室技术人员负责仪器设备的维修、维护工作。对在用仪器设备做到：操作规范、保养及时、定期维护，损坏及时登记、报修并有维修记录，使仪器设备长期处于完好可用状态。
