中心实行在“临床技能实践教学专家委员会”及“医院灾害医学教育分委会”指导下的中心主任负责制，注重组织、制度和机制3个方面保障，实行“五统一”的管理模式——统一安排教学任务、统一协调临床教学师资、统一规章制度、统一购置与管理设备、统一技能考试标准。为保证中心可持续发展，完善了岗位责任制，建立了经费配套机制、学术促进机制和职称倾斜支持机制，实现了资源共享和高效管理。
