学校心理健康教育机构最主要的职能是为本校学生的心理健康提供一体化专业服务(包括个体咨询、团体辅导、危机干预等),开展各种形式的心理健康教育活动(包括心理健康知识宣传,心理健康课程与讲座,心理沙龙等专题活动),立足教育和发展。其他职能还包括为学生和家长提供促进心理素质发展的指导性意见,协助他们共同解决孩子在发展过程中的心理行为问题,为学校德育工作提供意见和建议,营造积极的关注心理健康的校园环境。