根据病毒能否使细胞产生病变将BVDV 分为非致细胞病变型和致细胞病变型两个生物型。病毒生物型的划分与急性、先天性和慢性感染等临床症候群有关。根据病毒基因组5’非编码区（5’UTR）的序列将BVDV 分为两个基因型，即BVDV1 和BVDV2。BVDV1 可分为11 个不同的基因亚型BVDV1a-k，主要流行亚型是1a 和1b，代表株分别是NADL 和Osloss 株；BVDV2 的代表株是890 株。BVDV1 普遍用于疫苗生产、诊断和研究。
