梅迪-维斯纳病毒基因组为单股RNA,大小为9 189~9 256 bp。病毒基因组由5’末端重复序列、结构蛋白编码区、具有多种酶活性的蛋白编码区、外膜蛋白、3 个辅助调控基因和3’末端重复序列组成,含有6 个开放阅读框,基因编码区之间存在部分重叠。